IMG 4 version of the integrated microbial genomes comparative analysis system.
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DOI：
10.1093/nar/gkt963
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发表时间：
2014-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Kyrpides NC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Markowitz VM;Chen IM;Palaniappan K;Chu K;Szeto E;Pillay M;Ratner A;Huang J;Woyke T;Huntemann M;Anderson I;Billis K;Varghese N;Mavromatis K;Pati A;Ivanova NN;Kyrpides NC
综合微生物基因组(IMG)数据仓库整合了所有三个生命领域的基因组，以及质粒、病毒和基因组片段。IMG提供了在比较的背景下分析和审查基因组的结构和功能注释的工具。自2005年发布第一个版本以来，IMG的数据内容和分析能力不断增加。自2012年NAR数据库的最后一期报告发表以来，IMG的注释和数据集成管道已经发生了变化，同时增加了用于记录和分析单细胞基因组、RNA序列和生物合成集群数据的新工具。不同的IMG数据中心为可公开获得的基因组分析提供支持(img/W：http://img.jgi.doe.gov/w)，基因组注释专家评审(img/ER：http://img.jgi.doe.gov/er))以及微生物基因组分析领域的教学和培训(img/edu：http://img.jgi.doe.gov/edu).
The Integrated Microbial Genomes (IMG) data warehouse integrates genomes from all three domains of life, as well as plasmids, viruses and genome fragments. IMG provides tools for analyzing and reviewing the structural and functional annotations of genomes in a comparative context. IMG’s data content and analytical capabilities have increased continuously since its first version released in 2005. Since the last report published in the 2012 NAR Database Issue, IMG’s annotation and data integration pipelines have evolved while new tools have been added for recording and analyzing single cell genomes, RNA Seq and biosynthetic cluster data. Different IMG datamarts provide support for the analysis of publicly available genomes (IMG/W: http://img.jgi.doe.gov/w), expert review of genome annotations (IMG/ER: http://img.jgi.doe.gov/er) and teaching and training in the area of microbial genome analysis (IMG/EDU: http://img.jgi.doe.gov/edu).
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