Transcriptomic study of anastasis for reversal of ethanol-induced apoptosis in mouse primary liver cells.
Transcriptomic study of anastasis for reversal of ethanol-induced apoptosis in mouse primary liver cells.
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DOI：
10.1038/s41597-022-01470-8
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发表时间：
2022-07-18
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Tang, Ho Lam
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Tang, Ho Man;Talbot, C. Conover, Jr.;Fung, Ming Chiu;Tang, Ho Lam
恢复是一种细胞恢复机制，从死亡的边缘拯救垂死的细胞。细胞凋亡逆转是细胞转移的第一个例子。在这里，我们描述了一个全面的数据集，其中包含了乙醇诱导的小鼠原代肝细胞凋亡逆转的时间过程mRNA表达谱。该转录组数据包括未处理细胞的情况，用4.5%乙醇细胞死亡诱导剂孵育5小时引发细胞凋亡的细胞，以及用新鲜细胞培养基洗涤和孵育后乙醇诱导细胞在早期（第3小时）、中期（第6小时）和晚期（第24、48小时）的凋亡逆转。通过将该数据集与其他由不同细胞类型和细胞死亡诱导剂组合产生的转移模型的转录组学特征进行比较，研究人员可以确定控制细胞凋亡逆转和其他可逆细胞死亡过程的关键调节因子。因此，重用或重新分析该数据集将有助于未来对转移的生理、病理和治疗意义的研究。
Anastasis is a cell recovery mechanism that rescues dying cells from the brink of death. Reversal of apoptosis is the first example of anastasis. Here, we describe a comprehensive dataset containing time-course mRNA expression profiles for reversal of ethanol-induced apoptosis in mouse primary liver cells in νitro. This transcriptome dataset includes the conditions of the untreated cells, cells undergoing apoptosis triggered by incubating with cell death inducer of 4.5% ethanol for 5 hours, and apoptosis reversal of ethanol-induced cells at the early (3rd hour), middle (6th hour), and late (24th, 48th hour) stages after being washed with and incubated in fresh cell culture medium. By comparing this dataset with the transcriptomic profiles of other anastasis models generated with different combinations of cell types and cell death inducers, investigators can identify the key regulators governing reversal of apoptosis and other reversible cell death processes. Therefore, reusing or reanalysing this dataset will facilitate the future studies on the physiological, pathological, and therapeutic implications of anastasis.
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影响因子：
64.8
作者：
Halpern KB;Shenhav R;Matcovitch-Natan O;Toth B;Lemze D;Golan M;Massasa EE;Baydatch S;Landen S;Moor AE;Brandis A;Giladi A;Avihail AS;David E;Amit I;Itzkovitz S
通讯作者：
Itzkovitz S
影响因子：
--
作者：
Schroeder A;Mueller O;Stocker S;Salowsky R;Leiber M;Gassmann M;Lightfoot S;Menzel W;Granzow M;Ragg T
通讯作者：
Ragg T
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16.6
作者：
Sun G;Ding XA;Argaw Y;Guo X;Montell DJ
通讯作者：
Montell DJ
影响因子：
7.7
作者：
Ding, Austin Xun;Sun, Gongping;Montell, Denise J.
通讯作者：
Montell, Denise J.
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1.9
作者：
Nguyen, DV;Arpat, AB;Carroll, RJ
通讯作者：
Carroll, RJ