Complete chloroplast genome sequences of two Amomum species (Zingiberaceae).
Complete chloroplast genome sequences of two Amomum species (Zingiberaceae).
复制标题
两种砂仁（姜科）的完整叶绿体基因组序列
DOI：
10.1080/23802359.2019.1682951
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发表时间：
2019-10-26
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Li GD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang YM;Yang CW;Liu YY;Yang YW;Liu XL;Li GD
草果和草果是我国著名的药食两用植物，具有浓郁的香味。本研究对草果和草果的叶绿体基因组进行了全序列测定，其长度分别为163，612 bp和163，487 bp，LSC和SSC区域被一对反向重复区所分隔。对A. tsao-ko有120个注释基因，其中蛋白质编码基因82个，而A. paratsaoko有121个注释基因，包括83个蛋白质编码基因。两个cp基因组均含有30个tRNA基因和8个rRNA基因。利用28个种的叶绿体基因组DNA序列进行系统发育分析，结果表明：A. tsao-ko和A. paratsaoko与100%的自助值。
Amomum tsao-ko and Amomum paratsaoko are well known medicinal and edible plants with a strong fragrance and flavour in China. Here, we have sequenced the two complete chloroplast genomes of Amomum tsao-ko and Amomum paratsaoko, which are 163,612 bp and 163,487 bp in length, respectively, and exhibited LSC and SSC regions separated by a pair of inverted repeat regions. The cp genome of A. tsao-ko has 120 annotated genes, including 82 protein-coding genes, while A. paratsaoko has 121 annotated genes, including 83 protein-coding genes. Both cp genomes contained 30 tRNA genes and 8 rRNA genes. Phylogenetic analysis using a total chloroplast genome DNA sequence of 28 species revealed a close relationship between A. tsao-ko and A. paratsaoko with 100% bootstrap value.
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作者：
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通讯作者：
Standley DM
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作者：
Dierckxsens N;Mardulyn P;Smits G
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Smits G
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu033
发表时间：
2014-05-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Stamatakis A
通讯作者：
Stamatakis A