RAD marker microarrays enable rapid mapping of zebrafish mutations.
RAD marker microarrays enable rapid mapping of zebrafish mutations.
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DOI：
10.1186/gb-2007-8-6-r105
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发表时间：
2007
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Johnson EA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Miller MR;Atwood TS;Eames BF;Eberhart JK;Yan YL;Postlethwait JH;Johnson EA
构建RAD标记微阵列是为了促进斑马鱼突变的快速遗传图谱，并用于将之前未映射的突变定位到长度仅几厘米摩根的基因组区域。我们构建了限制性位点相关DNA（RAD）标记微阵列，以促进斑马鱼突变的快速遗传定位。使用这些微阵列与批量分离的方法，我们定位以前未映射的突变基因组区域只有几厘米长。此外，我们开发了一种方法来分析合并人群中的单个RAD标志物，并细化了一个区域。RAD方法对于斑马鱼的遗传作图是非常有效的，并且对于其它生物的作图是有吸引力的选择。
A RAD marker microarray was constructed to facilitate rapid genetic mapping of zebrafish mutations and used to localize previously unmapped mutations to genomic regions just a few centiMorgans in length. We constructed a restriction site associated DNA (RAD) marker microarray to facilitate rapid genetic mapping of zebrafish mutations. Using these microarrays with a bulk segregant approach, we localized previously unmapped mutations to genomic regions just a few centiMorgans in length. Furthermore, we developed an approach to assay individual RAD markers in pooled populations and refined one region. The RAD approach is highly effective for genetic mapping in zebrafish and is an attractive option for mapping in other organisms.
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