Parametric surface modeling and registration for comparison of manual and automated segmentation of the hippocampus.
Parametric surface modeling and registration for comparison of manual and automated segmentation of the hippocampus.
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DOI：
10.1002/hipo.20613
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发表时间：
2009-06
期刊：
影响因子：
3.5
通讯作者：
West, John D.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shen, Li;Firpi, Hiram A.;Saykin, Andrew J.;West, John D.
从大脑图像中准确有效地分割海马体是一个具有挑战性的问题。尽管经验丰富的解剖示踪剂可能是可靠的，但手动分割是一个耗时的过程，并且对于大规模神经影像研究来说可能不可行。在本文中，我们使用现有 MCI/AD 队列的数据，将自动化方法 FreeSurfer (V4) 与已发布的通过 MRI 扫描确定海马边界的手动方案进行比较。为了进行比较，我们开发了一个增强的球谐处理框架来建模和记录这些海马痕迹。该框架将两个海马体视为单个几何配置，并提取多对象设置中的位置、方向和形状变量。我们应用这个框架来注册手动追踪和 FreeSurfer 结果，这两种方法在位置和方向上表现出比形状测量更强的一致性。正在开展研究完善的 FreeSurfer 分割策略的工作，预计会在形状特征上达成改进的协议。
Accurate and efficient segmentation of the hippocampus from brain images is a challenging issue. Although experienced anatomic tracers can be reliable, manual segmentation is a time consuming process and may not be feasible for large-scale neuroimaging studies. In this paper, we compare an automated method, FreeSurfer (V4), with a published manual protocol on the determination of hippocampal boundaries from MRI scans, using data from an existing MCI/AD cohort. To perform the comparison, we develop an enhanced spherical harmonic processing framework to model and register these hippocampal traces. The framework treats the two hippocampi as a single geometric configuration and extracts the positional, orientation and shape variables in a multi-object setting. We apply this framework to register manual tracing and FreeSurfer results together and the two methods show stronger agreement on position and orientation than shape measures. Work is in progress to examine a refined FreeSurfer segmentation strategy and an improved agreement on shape features is expected.
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影响因子：
5.7
作者：
Fischl, B;Sereno, MI;Dale, AM
通讯作者：
Dale, AM
影响因子：
2.8
作者：
Tae, Woo Suk;Kim, Sam Soo;Kim, Keun Woo
通讯作者：
Kim, Keun Woo
DOI：
10.1109/34.121791
发表时间：
1992-02-01
影响因子：
23.6
作者：
BESL, PJ;MCKAY, ND
通讯作者：
MCKAY, ND
影响因子：
5.7
作者：
Shen, DG;Moffat, S;Davatzikos, C
通讯作者：
Davatzikos, C
影响因子：
3.9
作者：
McHugh, Tara L.;Saykin, Andrew J.;Shen, Li
通讯作者：
Shen, Li