Current Methods and Pipelines for Image-Based Quantitation of Nuclear Shape and Nuclear Envelope Abnormalities.
Current Methods and Pipelines for Image-Based Quantitation of Nuclear Shape and Nuclear Envelope Abnormalities.
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DOI：
10.3390/cells11030347
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发表时间：
2022-01-20
期刊：
影响因子：
6
通讯作者：
Larrieu D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Janssen AFJ;Breusegem SY;Larrieu D
任何给定的细胞类型都具有相关的“正常”核形态，这对于维持适当的细胞功能和保护基因组完整性是重要的。偏离这一点可能表明疾病，如癌症或过早衰老综合征。为了准确评估核异常，重要的是使用核形态的定量测量。在这里，我们概述了几种核异常，包括微核、核被膜内陷、水泡和破裂，并回顾了当前用于基于图像量化这些异常的方法。我们讨论了几个参数，可用于量化核形状和比较它们的输出使用示例图像。此外，我们提出了新的管道定量分析核泡和内陷。核畸变和形状的定量分析在广泛的应用中将是重要的，从评估癌细胞异常到研究机械或其他类型的应力下的核变形性。
Any given cell type has an associated “normal” nuclear morphology, which is important to maintain proper cellular functioning and safeguard genomic integrity. Deviations from this can be indicative of diseases such as cancer or premature aging syndrome. To accurately assess nuclear abnormalities, it is important to use quantitative measures of nuclear morphology. Here, we give an overview of several nuclear abnormalities, including micronuclei, nuclear envelope invaginations, blebs and ruptures, and review the current methods used for image-based quantification of these abnormalities. We discuss several parameters that can be used to quantify nuclear shape and compare their outputs using example images. In addition, we present new pipelines for quantitative analysis of nuclear blebs and invaginations. Quantitative analyses of nuclear aberrations and shape will be important in a wide range of applications, from assessments of cancer cell anomalies to studies of nucleus deformability under mechanical or other types of stress.
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DOI：
10.1073/pnas.1702226114
发表时间：
2017-09-26
影响因子：
11.1
作者：
Chu, Fang-Yi;Haley, Shannon C.;Zidovska, Alexandra
通讯作者：
Zidovska, Alexandra
DOI：
10.1083/jcb.136.3.531
发表时间：
1997-02-10
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Fricker M;Hollinshead M;White N;Vaux D
通讯作者：
Vaux D
影响因子：
4.4
作者：
Fidzianska, A;Hausmanowa-Petrusewicz, I
通讯作者：
Hausmanowa-Petrusewicz, I
固定细胞和活细胞中核酸可视化的荧光探针。
DOI：
10.3390/molecules181215357
发表时间：
2013-12-11
期刊：
Molecules (Basel, Switzerland)
影响因子：
--
作者：
Boutorine AS;Novopashina DS;Krasheninina OA;Nozeret K;Venyaminova AG
通讯作者：
Venyaminova AG
影响因子：
12.3
作者：
Carpenter AE;Jones TR;Lamprecht MR;Clarke C;Kang IH;Friman O;Guertin DA;Chang JH;Lindquist RA;Moffat J;Golland P;Sabatini DM
通讯作者：
Sabatini DM