High-throughput behavioral analysis in C. elegans.
High-throughput behavioral analysis in C. elegans.
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秀丽隐杆线虫中的高通量行为分析。
DOI：
10.1038/nmeth.1625
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发表时间：
2011-06-05
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Kerr, Rex A.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Swierczek, Nicholas A.;Giles, Andrew C.;Rankin, Catharine H.;Kerr, Rex A.
我们设计了一个实时计算机视觉系统，多蠕虫跟踪器（MWT），可以同时量化的行为，几十个秀丽隐杆线虫在传统的培养皿上的视频速率。三个传统的行为范式使用这个系统进行检查：食物上的自发运动，其中的行为在几十分钟内发生变化;趋化性，其中必须准确地检测到转折事件，以确定策略;和习惯化的响应自来水，其中的响应是随机的，并随着时间的推移而变化。在每种情况下，手动分析或自动化的单蠕虫跟踪都是繁琐和耗时的，但MWT系统允许以最少的人力快速量化行为。因此，该系统将能够对复杂行为进行大规模正向和反向遗传筛查。
We have designed a real-time computer vision system, the Multi-Worm Tracker (MWT), that can simultaneously quantify the behavior of dozens of Caenorhabditis elegans on a traditional petri plate at video rates. Three traditional behavioral paradigms are examined using this system: spontaneous movement on food, where the behavior changes over tens of minutes; chemotaxis, where turning events must be detected accurately to determine strategy; and habituation of response to tap, where the response is stochastic and changes over time. In each case, manual analysis or automated single-worm tracking would be tedious and time-consuming, but the MWT system allows rapid quantification of behavior with minimal human effort. Thus, this system will enablelarge scale forward and reverse genetic screens for complex behaviors.
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