The underappreciated role of allostery in the cellular network.
The underappreciated role of allostery in the cellular network.
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DOI：
10.1146/annurev-biophys-083012-130257
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发表时间：
2013
影响因子：
12.4
通讯作者：
Ma B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Nussinov R;Tsai CJ;Ma B
变构传播导致蛋白质结构中不同位置之间的通信；它还编码对细胞路径的特定影响，并以这种方式塑造细胞反应。长期效应的一个例子是形态原与细胞表面受体的结合，这启动了一系列蛋白质相互作用，导致基因组激活和特定的细胞行动。变构传播是多种因素组合的结果；通过构象系综的动态变化发生；并影响大分子相互作用的平衡。在这里，我们强调变构在通过大的多分子组装和距离传递明确的信号以指定细胞行为方面的众所周知但仍未被认识的作用；对变构效应进行量化的必要性；最后，我们提出沿着该途径的变构效应的每一种特定组合都具有不同的功能。挑战是巨大的；鼓舞人心的回报将是预测药物制度的功能、故障和结果。
Allosteric propagation results in communication between distinct sites in the protein structure; it also encodes specific effects on cellular pathways, and in this way it shapes cellular response. One example of long-range effects is binding of morphogens to cell-surface receptors, which initiates a cascade of protein interactions that leads to genome activation and specific cellular action. Allosteric propagation results from combinations of multiple factors; takes place through dynamic shifts of conformational ensembles; and affects the equilibria of macromolecular interactions. Here, we emphasize the well-known, yet still underappreciated role of allostery in conveying explicit signals across large multimolecular assemblies and distances to specify cellular action; the need for quantitation of the allosteric effects; and finally, we propose that each specific combination of allosteric effectors along the pathway spells a distinct function. The challenges are colossal; the inspiring reward will be predicting function, misfunction, and outcomes of drug regimes.
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DOI：
10.1016/j.str.2009.06.008
发表时间：
2009-08-12
期刊：
Structure (London, England : 1993)
影响因子：
--
作者：
del Sol A;Tsai CJ;Ma B;Nussinov R
通讯作者：
Nussinov R
DOI：
10.1073/pnas.1207040109
发表时间：
2012-07-31
影响因子：
11.1
作者：
Biter, Amadeo B.;Lee, Sukyeong;Tsai, Francis T. F.
通讯作者：
Tsai, Francis T. F.
影响因子：
5.4
作者：
Durrant JD;McCammon JA
通讯作者：
McCammon JA
影响因子：
13.8
作者：
Csermely, Peter;Palotai, Robin;Nussinov, Ruth
通讯作者：
Nussinov, Ruth
影响因子：
4.3
作者：
Dixit A;Verkhivker GM
通讯作者：
Verkhivker GM