A Proximity Labeling Strategy Provides Insights into the Composition and Dynamics of Lipid Droplet Proteomes.
A Proximity Labeling Strategy Provides Insights into the Composition and Dynamics of Lipid Droplet Proteomes.
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DOI：
10.1016/j.devcel.2017.11.020
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发表时间：
2018-01-08
影响因子：
11.8
通讯作者：
Olzmann JA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bersuker K;Peterson CWH;To M;Sahl SJ;Savikhin V;Grossman EA;Nomura DK;Olzmann JA
脂滴（LD）的功能是由与边界LD磷脂单层相关的完整和外周蛋白质的补体调节的。定义LD蛋白质组的组成仍然是一个挑战，由于存在污染的蛋白质在LD富集的浮力部分。为了克服这一限制，我们开发了一种邻近标记策略，该策略利用LD靶向的APEX2来生物素化活细胞中的LD蛋白。将这种方法应用于两种不同的细胞类型，鉴定了绝大多数先前验证的LD蛋白，排除了常见的污染蛋白，并揭示了新的LD蛋白。此外，LD蛋白质组动力学的定量分析揭示了内质网相关的降解在控制LD蛋白质组的组成中的作用。这些数据提供了一个重要的资源，为未来的LD研究，并证明了实用的邻近标记研究LD蛋白质组的调节。
Lipid droplet (LD) functions are regulated by a complement of integral and peripheral proteins that associate with the bounding LD phospholipid monolayer. Defining the composition of the LD proteome has remained a challenge due to the presence of contaminating proteins in LD-enriched buoyant fractions. To overcome this limitation, we developed a proximity labeling strategy that exploits LD-targeted APEX2 to biotinylate LD proteins in living cells. Application of this approach to two different cell types identified the vast majority of previously validated LD proteins, excluded common contaminating proteins, and revealed new LD proteins. Moreover, quantitative analysis of LD proteome dynamics uncovered a role for endoplasmic reticulum-associated degradation in controlling the composition of the LD proteome. These data provide an important resource for future LD studies and demonstrate the utility of proximity labeling to study the regulation of LD proteomes.
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影响因子：
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作者：
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Bendayan, M
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