EpiCompare: R package for the comparison and quality control of epigenomic peak files.
EpiCompare: R package for the comparison and quality control of epigenomic peak files.
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DOI：
10.1093/bioadv/vbad049
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发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
EpiCompare 结合了各种下游分析工具来比较、质量控制和基准不同的表观基因组数据集。该软件包需要用户最少的输入，只需一行代码即可运行，并在单个交互式 HTML 报告中提供所有分析结果。 EpiCompare 因此能够以简单、有效和用户友好的方式对多个表观基因组数据集进行下游分析。 EpiCompare 可在 Bioconductor (≥ v3.15) 上使用：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/EpiCompare.html；所有源代码均可通过 GitHub 公开获取：https://github.com/neurogenomics/EpiCompare；文档网站 https://neurogenomics.github.io/EpiCompare；和 EpiCompare DockerHub 存储库：https://hub.docker.com/repository/docker/neurogenomicslab/epicompare。
EpiCompare combines a variety of downstream analysis tools to compare, quality control and benchmark different epigenomic datasets. The package requires minimal input from users, can be run with just one line of code and provides all results of the analysis in a single interactive HTML report. EpiCompare thus enables downstream analysis of multiple epigenomic datasets in a simple, effective and user-friendly manner. EpiCompare is available on Bioconductor (≥ v3.15): https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/EpiCompare.html; all source code is publicly available via GitHub: https://github.com/neurogenomics/EpiCompare; documentation website https://neurogenomics.github.io/EpiCompare; and EpiCompare DockerHub repository: https://hub.docker.com/repository/docker/neurogenomicslab/epicompare.
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影响因子：
2.2
作者：
Ding X;Huang S;Leung A;Rabbany R
通讯作者：
Rabbany R
影响因子：
4.6
作者：
Layton AT;Sadria M
通讯作者：
Sadria M
DOI：
10.3138/jammi-2020-0030
发表时间：
2020-12-01
期刊：
Journal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada = Journal officiel de l'Association pour la microbiologie medicale et l'infectiologie Canada
影响因子：
--
作者：
Byambasuren, Oyungerel;Cardona, Magnolia;Glasziou, Paul
通讯作者：
Glasziou, Paul
影响因子：
7.8
作者：
Shang W;Kang L;Cao G;Wang Y;Gao P;Liu J;Liu M
通讯作者：
Liu M
DOI：
10.1098/rspa.1927.0118
发表时间：
1927-08-01
期刊：
PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY OF LONDON SERIES A-CONTAINING PAPERS OF A MATHEMATICAL AND PHYSICAL CHARACTER
影响因子：
--
作者：
Kermack, WO;McKendrick, AG
通讯作者：
McKendrick, AG