Exploring the microbiome of healthy and diseased peri-implant sites using Illumina sequencing.
Exploring the microbiome of healthy and diseased peri-implant sites using Illumina sequencing.
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DOI：
10.1111/jcpe.12788
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发表时间：
2017-12
影响因子：
6.7
通讯作者：
Teles FRF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sanz-Martin I;Doolittle-Hall J;Teles RP;Patel M;Belibasakis GN;Hämmerle CHF;Jung RE;Teles FRF
比较健康 (H) 和患病 (P) 种植体周围部位的微生物组并确定核心种植体周围微生物组。使用 16S rRNA 测序（MiSeq、Illumina）、QIIME 和 HOMINGS 分析来自 32 H 和 35 P 位点的粘膜下生物膜。使用主坐标分析 (PCoA)、t 检验和 Wilcoxon 秩和检验以及 FDR 调整来确定组之间的差异。确定了种植体周围核心微生物组。 PCoA 在所有分类水平上都显示出 H 和 P 之间的划分。 P 中拟杆菌门、螺旋菌门和协同菌门较高，而 H 中放线菌占优势（p<0.05）。 P 中卟啉单胞菌和密螺旋体的含量更高，而 H 中 Rothia 和 Neisseria 的含量更高 (p<0.05)。种植体周围的核心微生物组包含梭杆菌属、细单胞菌属和弯曲杆菌属。 P. denticola 和 P. gingivalis 的水平在 P 中较高，F. alocis、F. fastidiosum 和 T. maltophilum 的水平也较高 (p<0.05)。种植体周围炎微生物组共生体耗尽且病原体丰富，含有传统和新病原体。种植体周围的核心微生物组包含通常与牙周炎症相关的属的分类群。
To compare the microbiome of healthy (H) and diseased (P) peri-implant sites and determine the core peri-implant microbiome. Submucosal biofilms from 32 H and 35 P sites were analyzed using 16S rRNA sequencing (MiSeq, Illumina), QIIME and HOMINGS. Differences between groups were determined using Principal Coordinate Analysis (PCoA), t-tests and Wilcoxon rank sum test and FDR-adjusted. The peri-implant core microbiome was determined. PCoA showed partitioning between H and P at all taxonomic levels. Bacteroidetes, Spirochetes and Synergistetes were higher in P, while Actinobacteria prevailed in H (p<0.05). Porphyromonas and Treponema were more abundant in P and while Rothia and Neisseria were higher in H (p<0.05). The core peri-implant microbiome contained Fusobacterium, Parvimonas and Campylobacter sp. T. denticola and P. gingivalis levels were higher in P, as well as F. alocis, F fastidiosum and T. maltophilum (p<0.05). The peri-implantitis microbiome is commensal-depleted and pathogen-enriched, harboring traditional and new pathogens. The core peri-implant microbiome harbors taxa from genera often associated with periodontal inflammation.
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DOI：
10.1038/ismej.2012.8
发表时间：
2012-08
期刊：
The ISME journal
影响因子：
--
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
6.7
作者：
Heitz-Mayfield, Lisa J. A.
通讯作者：
Heitz-Mayfield, Lisa J. A.
影响因子：
7.6
作者：
Derks, J.;Schaller, D.;Berglundh, T.
通讯作者：
Berglundh, T.
影响因子：
3.7
作者：
Belstrøm D;Holmstrup P;Bardow A;Kokaras A;Fiehn NE;Paster BJ
通讯作者：
Paster BJ
DOI：
10.1073/pnas.1000080107
发表时间：
2011-03-15
影响因子：
11.1
作者：
Caporaso, J. Gregory;Lauber, Christian L.;Knight, Rob
通讯作者：
Knight, Rob