Significant downregulation of platelet gene expression in metastatic lung cancer.
Significant downregulation of platelet gene expression in metastatic lung cancer.
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DOI：
10.1111/j.1752-8062.2010.00226.x
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发表时间：
2010-10
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Geraci MW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Calverley DC;Phang TL;Choudhury QG;Gao B;Oton AB;Weyant MJ;Geraci MW
血小板在体内肿瘤细胞的转移扩散中发挥重要作用。最近的证据表明，巨核细胞来源的血小板前 mRNA 被剪接到 mRNA 上，然后翻译成功能蛋白以响应外部刺激。采用人类肺癌模型，我们假设存在巨核细胞/血小板基因的子集，与非癌症相比，这些基因在转移中显着过度表达或表达不足。使用血小板 mRNA 进行微阵列分析，然后进行无监督的分层聚类，揭示了一种表达谱，其中 200 个血小板基因中有 197 个表达量下降，表达变化最大 (P<1.0×10-4)。在转移组和阴性对照组之间鉴定的 608 个剪接事件中，鉴定出 33 个高度可变的基因，每个基因有 3 至 13 个剪接事件。总之，这项初步研究揭示了一种基于血小板的基因表达特征，该特征可以根据表达水平变化最大的 200 个基因中的 197 个基因的表达降低来区分转移性肺癌和阴性对照。进一步的研究可能会为早期肺癌患者的未来转移提供一个预后工具。
Platelets play a major role in the metastatic dissemination of tumor cells in vivo. Recent evidence reveals megakaryocyte-derived platelet pre-mRNA is spliced to mRNA and then translated into functional proteins in response to external stimulation. Employing a human lung cancer model, we hypothesized a subset of megakaryocyte/platelet genes exists that are significantly over or underexpressed in metastasis compared with non-cancer. Microarray analysis employing platelet mRNA followed by unsupervised hierarchical clustering revealed an expression profile that includes decreased expression of 197 of the 200 platelet genes with the most altered expression (P<1.0×10-4). Among the 608 splicing events identified between the metastasis and negative control groups, 33 highly variable genes were identified with between 3 and 13 splicing events each. In conclusion this preliminary study reveals a platelet-based gene expression signature that differentiates metastatic lung cancer from negative controls on the basis of decreased expression of 197 of the 200 genes with the most altered expression levels. Further study may yield a prognostic tool for future metastasis among subsets of early stage lung cancer patients.
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