Functional studies of essential amino acid residues of the palm subdomain of the RNA dependent RNA polymerase (RdRp) of Tomato Bushy Stunt Virus (TBSV-BS3 Statice) and Turnip Crinkle Virus (TCV)

番茄浓密特技病毒 (TBSV-BS3 Statice) 和芜菁皱纹病毒 (TCV) 的 RNA 依赖性 RNA 聚合酶 (RdRp) 棕榈亚结构域必需氨基酸残基的功能研究

• 批准号: 15233008
• 负责人: Dr. Kajohn Boonrod
• 金额: --
• 依托单位: AlPlanta Institute for Plant Research
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2004-12-31 至 2007-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/15233008?language=en
• 关键词: Functional; studies; essential; amino; acid

Das Tomato Bushy Stunt Virus (TBSV), der Repräsentant des Genus Tombusvirus und das Turnip Crinkle Virus (TCV) besitzen ein plus Strang RNA Genom, das für 5 Gene kodiert. Der erste offene Leserahmen kodiert ein 33 kDa Protein (p33), das in die virale Replikation involviert ist. Das Überlesen eines Amber Stop Codons am Ende des p33 Leserahmens fuhrt zur Bildung eines 92 kDa Fusionsproteins. Der durch das Überlesen entstandene Teil dieses Fusionsproteins enthält die bekannten konservierten RdRp Motive. Das p92 besitzt voraussichtlich die sog. Finger (Finger), Palm (Handfläche) und Thumb (Daumen) Sub-Domänen von RdRps. Die Palm Sub-Domaine der Tombusvirus RdRp enthält die 5 Motive, die in allen Klassen von Polymerasen gefunden werden können. Die Sekundärstruktur der meisten dieser Motive ist bei den zur Supergruppe 2 gehörigen (+) Strang viralen RdRps hoch konserviert. Es existieren jedoch Unterschiede in der Aminosäure Sequenz und sogar in der Sekundärstruktur z.B. des Motivs E: Bei Tombusviren wird für das Motiv E eine Alpha Helix als Sekundärstruktur vorausgesagt, wohingegen das Motiv E in vielen anderen RdRps wie z.B. der Poliovirus RdRp (3Dpol) oder der Hepatitis B virus RdRp eine Beta Faltblatt Struktur annimmt. Untersuchungen dieser Motive sollen dazu fuhren, die Funktion der TBSV und TCV RdRp aufzuklären und mit der Funktion anderer RdRps aus derselben Supergruppe zu vergleichen. Die Ergebnisse dieser Untersuchungen werden auch ermöglichen, neue anti-virale Wirkstoffe zu entwickeln und virale Vektoren für das Molecular Pharming zu optimieren.

番茄丛矮病毒（Tomato Bushy Stunt Virus，TBSV）是番茄病毒属（Tombusvirus）和芜菁皱缩病毒属（Turnip Crinkle Virus，TCV）的代表病毒。首先提供的是一种33 kDa的蛋白质（p33），这与病毒感染有关。在p33基因末端的琥珀终止密码子可以促进92 kDa融合蛋白的形成。Der durch das Überlesen entstandene Teil dieses Fusionsproteins enthält die bekannten konservierten RdRp Motive.第92页是我的最爱。Finger（Finger），Palm（Handfläche）und Thumb（Daumen）Sub-Domänen von RdRps. TombusvirusRdRp的棕榈亚区有5个动机，在聚合物的艾伦Klassen中都有韦尔登。最大动机的Sekundärstruktur存在于Supergruppe 2 gehörigen（+）斯特朗viralen RdRps hoch conserviert中。在氨基酸序列中的不确定性和在Sekundärstruktur z.B. des Motivs E：Bei Tombusviren wird für das Motiv E eine Alpha Hellenals Sekundärstruktur vorausgesagt，wohingegen das Motiv E in vielen anderen RdRps wie z.B.脊髓灰质炎病毒RdRp（3Dpol）或B型肝炎病毒RdRp一种β Faltblatt Struktur annimmt。根据这一动机，TBSV和TCV RdRp的功能将得到增强，并将其与来自超级集团的RdRp的功能相结合。Die Ergebnisse dieser Untersuchungen韦尔登auch ermöglichen，neue anti-virale Wirkstoffe zu entwickeln and virale Vektoren für das Molecular Pharming zu optimieren.