ITR: Accelerated Algorithms for Multiple Time Scale Simulations of Ultraslow Systems: Supercooled Liquids and Biomolecules

ITR:超慢系统多时间尺度模拟的加速算法:过冷液体和生物分子

基本信息

  • 批准号:
    0312959
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 49.99万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Standard Grant
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2003-09-01 至 2007-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Thomas Keyes, John Straub, and Steven Homer of Boston University are supported by the Chemistry Division and the Division of Materials Research under the Information Technology Research program to develop and apply algorithms for multiple time scale simulations of supercooled liquids and biomolecules. Three different algorithms are being developed for acceleration of transitions between different local minima. All three depend on methods for identifying local minima, transition barriers, and pathways in complicated molecular systems.Biologically interesting processes may be characterized by slow transitions between dissimilar molecular configurations. Dynamical processes on a much faster time scale occur rapidly within each of the configurations and during the slow transition between the two configurations. A simultaneous accurate accounting of both slow and fast processes represents a significant challenge to computational chemists and materials scientists. This work merges techniques for mathematically describing landscapes near a local minimum with information technology methods to allow for modeling of such slow events. The research is strongly coupled to educational activities that are designed to expose young researchers to the multiple time scale problem.
波士顿大学的Thomas Kyes、John Straub和Steven Hmer在信息技术研究计划下的化学部和材料研究部的支持下,开发和应用过冷液体和生物分子的多时间尺度模拟的算法。目前正在开发三种不同的算法来加速不同局部极小值之间的转换。这三种方法都依赖于识别复杂分子系统中的局部极小值、跃迁障碍和路径的方法。生物学上有趣的过程可能是不同分子构型之间的缓慢跃迁。在每种配置内以及在两种配置之间的缓慢过渡期间,在快得多的时间尺度上的动态过程迅速发生。对计算化学家和材料科学家来说,同时准确地计算慢过程和快过程是一个巨大的挑战。这项工作融合了以数学方式描述接近局部极小值的地貌的技术和信息技术方法,以允许对这种缓慢事件进行建模。这项研究与旨在让年轻研究人员接触多时间尺度问题的教育活动密切相关。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Thomas Keyes其他文献

Nonequilibrium critical phenomena in one-component reaction-diffusion systems.
单组分反应扩散系统中的非平衡临界现象。
Crossover in nonequilibrium multicritical phenomena of reaction-diffusion systems.
反应扩散系统非平衡多临界现象的交叉。

Thomas Keyes的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Thomas Keyes', 18)}}的其他基金

SGER: Replica Exchange STMD for CHARMM: a Potentially Large Advance in Biophysical Computing
SGER:CHARMM 的副本交换 STMD:生物物理计算领域的潜在重大进步
  • 批准号:
    0833605
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Classical Polarization and the Structure and Spectroscopy of Aqueous and Protein+Ligand Systems
经典偏振以及水和蛋白质配体系统的结构和光谱学
  • 批准号:
    0848427
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Ultraslow Dynamics and Ultrafast Spectroscopy in Liquids, with Connections to Thermodynamics
液体中的超慢动力学和超快光谱学,与热力学的联系
  • 批准号:
    0352026
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Theory and Simulation of Fast and Slow Dynamics in Liquids
液体中快慢动力学的理论与模拟
  • 批准号:
    0090975
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Instantaneous Normal Mode Analysis of Liquids
液体的瞬时简正模分析
  • 批准号:
    9708055
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Normal Mode Analysis of Liquids
液体的简正模分析
  • 批准号:
    9415216
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Problems in Statistical Mechanics
统计力学问题
  • 批准号:
    9100099
  • 财政年份:
    1991
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Problems in Statistical Mechanics
统计力学问题
  • 批准号:
    8802473
  • 财政年份:
    1988
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Problems in Statistical Mechanics (Chemistry)
统计力学问题(化学)
  • 批准号:
    8411303
  • 财政年份:
    1984
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Problems in Statistical Mechanics (Chemistry)
统计力学问题(化学)
  • 批准号:
    8312722
  • 财政年份:
    1983
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Standard Grant

相似海外基金

EAGER: Search-Accelerated Markov Chain Monte Carlo Algorithms for Bayesian Neural Networks and Trillion-Dimensional Problems
EAGER:贝叶斯神经网络和万亿维问题的搜索加速马尔可夫链蒙特卡罗算法
  • 批准号:
    2404989
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Distributed Algorithms for AI Accelerated Materials Discovery
AI 加速材料发现的分布式算法
  • 批准号:
    2906112
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Studentship
CAREER: Reliable and Accelerated Deep Neural Networks via Co-Design of Hardware and Algorithms
职业:通过硬件和算法的协同设计实现可靠且加速的深度神经网络
  • 批准号:
    2340516
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
Establish an accelerated design framework for lattice structures employing machine learning algorithms
采用机器学习算法建立晶格结构的加速设计框架
  • 批准号:
    2610103
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Studentship
HDR Institute: Accelerated AI Algorithms for Data-Driven Discovery
HDR 研究所:用于数据驱动发现的加速 AI 算法
  • 批准号:
    2117997
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Cooperative Agreement
CAREER: Efficient Algorithms and Hardware for Accelerated Machine Learning
职业:用于加速机器学习的高效算法和硬件
  • 批准号:
    1943349
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
FET: Small: Heterogeneous Learning Architectures and Training Algorithms for Hardware Accelerated Deep Spiking Neural Computation
FET:小型:硬件加速深度尖峰神经计算的异构学习架构和训练算法
  • 批准号:
    1911067
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Standard Grant
FET: Small: Heterogeneous Learning Architectures and Training Algorithms for Hardware Accelerated Deep Spiking Neural Computation
FET:小型:硬件加速深度尖峰神经计算的异构学习架构和训练算法
  • 批准号:
    1948201
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Standard Grant
Building Accelerated Denoising Algorithms for Graph Signal Processing
构建用于图信号处理的加速去噪算法
  • 批准号:
    18K18076
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Alternative algorithms for accelerated symbolic and numeric summation
加速符号和数字求和的替代算法
  • 批准号:
    238778-2012
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 49.99万
  • 项目类别:
    Discovery Grants Program - Individual
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了