QSB: Multiscale Modeling of Gene Regulatory Modules

QSB:基因调控模块的多尺度建模

基本信息

  • 批准号:
    0425882
  • 负责人:
  • 金额:
    --
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    美国
  • 项目类别:
    Continuing Grant
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    美国
  • 起止时间:
    2004-09-01 至 2008-08-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Kaznessis0425882This research focuses on the integration of a number of simulation algorithms into a seamless multiscale algorithm for modeling biological regulatory processes, which extend from a stochastic low-copy number regime to a high-concentration 'continuous' regime. This work builds on important earlier work, particularly that of Gillespie. The simulation algorithms which will be integrated are: a stochastic simulation algorithm; a chemical Langevin algorithm, to deal with conditions resulting in Gaussian fluctuations about a mean; and a multiscale deterministic simulation algorithm, to manage the continuous 'high concentration' range. An important goal of these studies is the creation of a 'platform' from which to approach in silico design of biologically interesting gene expression systems. These systems are described in some detail in the proposal, and include: bistable switching; simulation of oscillatory and biochemical systems; and multiscale deterministic modeling of metabolism.
Kaznessis 0425882这项研究的重点是集成了一些模拟算法到一个无缝的多尺度算法建模生物调控过程,从随机低拷贝数制度的高浓度的“连续”制度。 这项工作建立在重要的早期工作,特别是吉莱斯皮。 将被集成的模拟算法是:随机模拟算法;化学Langevin算法,处理导致平均值高斯波动的条件;和多尺度确定性模拟算法,管理连续的“高浓度”范围。 这些研究的一个重要目标是创建一个“平台”,从这个平台上可以通过计算机模拟设计生物学上感兴趣的基因表达系统。 这些系统在提案中有一些详细的描述,包括:振荡开关;振荡和生化系统的模拟;以及新陈代谢的多尺度确定性建模。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Yiannis Kaznessis其他文献

Yiannis Kaznessis的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Yiannis Kaznessis', 18)}}的其他基金

SBIR Phase I: Antiviral and Anti-inflammatory Live Biotherapeutics (COVID-19)
SBIR 第一阶段:抗病毒和抗炎活生物治疗药物 (COVID-19)
  • 批准号:
    2031154
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
Conference: 2012 Midwest Thermodynamics and Statistical Mechanics conference. University of Minnesota, May 20-22, 2012
会议:2012 年中西部热力学和统计力学会议。
  • 批准号:
    1162429
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
CAREER: Mathematics for Biological Engineering
职业:生物工程数学
  • 批准号:
    0644792
  • 财政年份:
    2007
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
NIH-NSF BBSI. THE UNIVERSITY OF MINNESOTA SUMMER BIOINFORMATICS INSTITUTE
NIH-NSF BBSI。
  • 批准号:
    0608910
  • 财政年份:
    2006
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Continuing Grant
NIH-NSF BBSI: The University of Minnesota Summer Bioinformatics Institute
NIH-NSF BBSI:明尼苏达大学夏季生物信息学研究所
  • 批准号:
    0234112
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Continuing Grant

相似海外基金

CAREER: From Underground to Space: An AI Infrastructure for Multiscale 3D Crop Modeling and Assessment
职业:从地下到太空:用于多尺度 3D 作物建模和评估的 AI 基础设施
  • 批准号:
    2340882
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Continuing Grant
CAREER: Multiscale Reduced Order Modeling and Design to Elucidate the Microstructure-Property-Performance Relationship of Hybrid Composite Materials
职业:通过多尺度降阶建模和设计来阐明混合复合材料的微观结构-性能-性能关系
  • 批准号:
    2341000
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
CAREER: Multiscale Modeling of Thrombus Formation and its Response to External Loads
职业:血栓形成的多尺度建模及其对外部负载的响应
  • 批准号:
    2340696
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
CDS&E: Multiscale Data Intensive Simulation and Modeling of Microemulsion Boiling: A New Paradigm for Boiling Enhancement
CDS
  • 批准号:
    2347627
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
CAREER: Predictive Multiscale Modeling of Cell Migration through Pores between Endothelial Cells
职业:通过内皮细胞之间的孔进行细胞迁移的预测多尺度建模
  • 批准号:
    2339054
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
IHBEM: Empirical analysis of a data-driven multiscale metapopulation mobility network modeling infection dynamics and mobility responses in rural States
IHBEM:对数据驱动的多尺度集合人口流动网络进行实证分析,对农村国家的感染动态和流动反应进行建模
  • 批准号:
    2327862
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Continuing Grant
CAREER: Data-driven Multiscale Modeling of Complex Traffic Systems Utilizing Networked Driving Simulators
职业:利用网络驾驶模拟器对复杂交通系统进行数据驱动的多尺度建模
  • 批准号:
    2238359
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Standard Grant
Multiscale modeling of electrochemical reactions in solid oxide cell electrodes
固体氧化物电池电极电化学反应的多尺度建模
  • 批准号:
    23K03707
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
CAREER: Revealing the interaction mechanisms of PICK1 using multiscale modeling
职业:使用多尺度建模揭示 PICK1 的相互作用机制
  • 批准号:
    2237369
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Continuing Grant
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了