AnnEvol - Evolution and phylogeny of Annelida based on phylogenomic data (i.e. EST libraries)

AnnEvol - 基于系统发育数据(即 EST 库)的环节动物的进化和系统发育

基本信息

项目摘要

Annelida is an ancient and very diverse animal taxon inhabiting diverse habitats from the deep sea to terrestrial soils. Being one of the three animal groups with segmentation, deciphering the evolution of Annelida is crucial to our understanding of the evolution of segmentation. Traditionally, Annelida comprised polychaetes (e.g., lugworms) and clitellates (e.g., earthworms and leeches). While the placement of Clitellata within polychaetes is well supported, their polychaete sistergroup is uncertain. It has been shown that the unsegmented animal “phyla” Sipuncula and Echiura as well as Myzostomida are part of the annelid radiation, but except for Echiura their annelid sistertaxa remain undetermined. Although more inclusive taxonomic units (Scolecida, Palpata, Canalipalpata, and Aciculata) have been put forward, resolving annelid relationships has been difficult using either morphological or molecular single or multiple gene data. Thus, the phylogeny of Annelida is still unresolved and any conclusions about the evolution of Annelida, like the form of the ancestral annelid either as burrowing or as crawling are contentious. This is calling into question the use of exemplar species as representatives of the ancestral annelid condition (e.g., Platynereis). On the other hand, preliminary data gathered by the two applicants show that substantially increasing the amount of molecular data per taxon using expressed sequence taqs (= EST) libraries results in an increase in both nodal support and congruence between analyses. Therefore, in this proposed project we want to resolve the phylogeny of Annelida using a phylogenomic approach based on EST libraries. EST libraries of several annelids shall be generated using 454 sequencing. This increases the amount of sequence information per taxon by three to four orders of a magnitude in comparison to the amplification of specific genes. We expect to robustly resolve the backbone of the annelid tree of life given our taxon sampling and thus to contribute to conclusions regarding the evolution of Annelida.
环节动物是一种古老而多样的动物分类单元,栖息在从深海到陆地土壤的各种栖息地。环节动物作为具有分节性的三大类群之一,对其进化过程的解读对我们理解分节性进化具有重要意义。传统上,环节动物包括多毛类(如蛔虫)和锁骨类(如蚯蚓和水蛭)。虽然cliitellata在多毛纲中的位置得到了很好的支持,但它们的多毛纲姐妹群是不确定的。研究表明,除棘足纲外,棘足纲、棘足纲和粘孔虫纲都是环节动物辐射的一部分,但它们的环节动物姐妹类群尚未确定。虽然已经提出了更广泛的分类单位(头尾纲、掌尾纲、管尾纲和针叶纲),但利用形态学或分子单基因或多基因数据来确定环节动物的关系一直很困难。因此,环节动物的系统发育仍未得到解决,任何关于环节动物进化的结论,如祖先环节动物的形式是穴居还是爬行,都是有争议的。这使人们对使用范例物种作为祖先环节动物条件的代表(例如,Platynereis)产生了疑问。另一方面,两位申请者收集的初步数据表明,使用表达序列taqs (= EST)文库大幅增加每个分类单元的分子数据量,可以增加节点支持度和分析之间的一致性。因此,在本项目中,我们希望利用基于EST文库的系统发育学方法来解决环节动物的系统发育问题。几种环节动物的EST文库将使用454测序生成。与特定基因的扩增相比,这增加了每个分类单元序列信息的数量,增加了三到四个数量级。我们期望通过我们的分类单元取样,有力地解决环节动物生命之树的主干问题,从而为有关环节动物进化的结论做出贡献。

项目成果

期刊论文数量(9)
专著数量(0)
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专利数量(0)
Description of a new syllid species as a model for evolutionary research of reproduction and regeneration in annelids
描述一种新的木虱物种作为环节动物繁殖和再生进化研究的模型
  • DOI:
    10.1007/s13127-014-0183-5
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Aguado;Weidhase;Bleidorn
  • 通讯作者:
    Bleidorn
Platyzoan paraphyly based on phylogenomic data supports a noncoelomate ancestry of spiralia.
基于系统发育数据的扁形动物并系动物支持旋涡虫的非腔皮动物祖先
  • DOI:
    10.1093/molbev/msu143
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    10.7
  • 作者:
    Struck;Wey-Fabrizius;Golombeck;Hering;Weigert;Bleidorn;Klebow;Iakovenko;Hausdorf;Petersen;Herlyn;Hankeln
  • 通讯作者:
    Hankeln
Systematics, evolution and phylogeny of Annelida – a morphological perspective
环节动物的系统学、进化和系统发育——形态学视角
  • DOI:
    10.24199/j.mmv.2014.71.19
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Purschke G;Bleidorn C;Struck T.H.
  • 通讯作者:
    Struck T.H.
The Evolution of Annelids Reveals Two Adaptive Routes to the Interstitial Realm
  • DOI:
    10.1016/j.cub.2015.06.007
  • 发表时间:
    2015-08-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    9.2
  • 作者:
    Struck, Torsten Hugo;Golombek, Anja;Halanych, Kenneth Michael
  • 通讯作者:
    Halanych, Kenneth Michael
The making of a branching annelid: an analysis of complete mitochondrial genome and ribosomal data of Ramisyllis multicaudata
  • DOI:
    10.1038/srep12072
  • 发表时间:
    2015-07-17
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Teresa Aguado, M.;Glasby, Christopher J.;Bleidorn, Christoph
  • 通讯作者:
    Bleidorn, Christoph
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