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Entwicklung neuer Bayesscher Netzwerkmodelle für die Systembiologieforschung

开发用于系统生物学研究的新贝叶斯网络模型

基本信息

批准号：
193900987
负责人：
Dr. Marco Grzegorczyk
金额：
--
依托单位：
Department of Mathematics and Natural Sciences
依托单位国家：
德国
项目类别：
Research Grants
财政年份：
2011
资助国家：
德国
起止时间：
2010-12-31 至 2013-12-31
项目状态：
已结题

来源：
https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/193900987?language=en
关键词：
Entwicklung neuer Bayesscher Netzwerkmodelle die

项目摘要

Die Systembiologie versucht die Regulierungsmechanismen der lebenden Zellen in ihrer gesamten Komplexität zu verstehen. Mit Biotechnologien werden dazu high-throughput Daten erhoben, auf deren Grundlage die zellulären Zusammenhänge untersucht werden. Die Messungen sind oft stark verrauscht, so dass für die Auswertung die Entwicklung solider statistischer Modelle notwendig ist. Von besonderem Interesse für die Systembiologie sind genregulatorische Netzwerke und Protein-Signal- Aktivierungskaskaden, die sowohl mit Differentialgleichungsmodellen als auch mit graphischen Modellen (u.a. Bayesschen Netzwerken) aus dem Datenmaterial extrahiert werden. Das Forschungsprojekt widmet sich der Weiterentwicklung Bayesscher Netzwerk Modelle: Neben einer Verbesserung der Modell-Flexibilität im Hinblick auf die Modellierung von nicht-linearen Regulierungsmechanismen und heterogenen dynamischen Regulierungsprozessen wird auch eine bessere Ausschöpfung von biologischem Prior-Wissen angestrebt. Die erste konkrete Anwendung beschäftigt sich mit der Modellierung der biologischen Uhr in Arabidopsis thaliana. Dabei wird der Einfluss des externen Faktors Licht untersucht. Das Einwirken von Licht nimmt Einfluss auf die genregulatorischen Mechanismen und sorgt für eine Synchronisierung zwischen der inneren molekularen Uhr und dem Tag/Nacht Zyklus. In der zweiten Anwendung wird die Auswirkung von fortschreitendem Brustkrebs auf regulatorische Netzwerke im Tumorgewebe analysiert. Es wird dabei genomweit nach Netzwerk-Veränderungen, die z.B. mit dem histologischen Tumorgrad einhergehen, gesucht.

系统生物学研究了生存环境中的调节机制。麻省理工学院生物技术韦尔登建立了高通量数据库，以确保细胞的基本功能得到韦尔登。Messungen经常被严重歪曲，因此没有必要使用Entwicklung Solider Statisticker Model。系统生物学的基本兴趣是遗传调节网络和蛋白质信号激活，其差异模型也可采用图形模型（美国）。Bayesschen Netzwerken）从额外的韦尔登中提取。这一研究项目包括加权贝叶斯网络模型：在Hinblick中对非线性调节机制和非均匀动力学调节过程的建模进行一次可扩展性检验，也是对生物先验知识的一次最好的检验。第一个问题是利用拟南芥的生物学Uhr模型。大北会受到外部因素的影响。Das Einquirken von Licht nimmt Einfluss auf die genregulatorischen Mechanismen und sorgt für eine Synchronisierung zwischen der inneren molekularen Uhr und dem Tag/Nacht Zyklus.在第二阶段，我们将通过分析肿瘤网络中的监管网络来加强对乳腺癌的支持。他的基因可能会被送到Netzwerk-Veränderungen，Z.B.。肿瘤组织学检查。