III: Small: Novel Geometric Algorithms for Learning from Big Biomedical Data
III: Small: Novel Geometric Algorithms for Learning from Big Biomedical Data
批准号:
1910492
负责人:
Jinhui Xu
金额:
$50.0万
依托单位:
依托单位国家:
美国
项目类别:
Standard Grant
财政年份:
2019
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-09-01 至 2023-08-31
中文摘要
生物医学大数据已经成为生物医学发现的关键资源。然而,由于它们的分布性以及敏感和噪声数据的存在,它们没有得到充分的利用。例如,大量的生物医学数据被生成并存储在不同的地点,如医院、药店和生物医学实验室,在收集、集成和利用这些数据时可能会出现许多挑战。因此,迫切需要更合适、更有效的技术来整合和分析它们。该项目旨在为生物医学大数据中常见的几个基本数据分析问题设计一套新的算法工具。该项目可能会提高收集和整合大型生物医学数据的能力,有效地利用这些数据,并处理不可靠和敏感的生物医学数据。具体地说,该项目将专注于四个数据分析问题:分布式真理发现、分布式分类、分布式聚类和差异私有学习。这些问题中的每一个都已被认为是数据分析和信息整合的关键工具。该项目解决了许多具有挑战性的问题(如通信成本、数据可靠性、健壮性、计算成本和隐私保护),并旨在为这些问题提供高效和有质量保证的解决方案。这四个研究目标将根据它们的有效性、效率和在特定生物医学数据集上的实用性进行评估。此外,这项研究将为研究生和本科生提供教育和研究机会,包括来自代表性不足群体的学生。该奖项反映了NSF的法定使命,并通过使用基金会的智力优势和更广泛的影响审查标准进行评估,被认为值得支持。
英文摘要
Big biomedical data has become a key resource for discovery in biomedicine. However, due to their distributed nature and the existence of sensitive and noisy data, they are not utilized to their full potential. For example, lots of biomedical data are generated and stored at different sites such as hospitals, pharmacies, and biomedical labs, numerous challenges could arise when gathering, integrating, and utilizing them. Thus, more suitable and effective techniques are urgently needed to integrate and analyze them. This project aims to design a set of novel algorithmic tools for several fundamental data analytics problems commonly encountered in big biomedical data. This project could potentially increase the ability of gathering and integrating big biomedical data, effectively exploiting such data, and handling unreliable and sensitive biomedical data. Specifically, the project will focus on four data analysis problems: distributed truth discovery, distributed classification, distributed clustering, and differentially private learning. Each of these problems has already been recognized as critical tools in data analysis and information integration. The project addresses a number of challenging issues (such as communication cost, data reliability, robustness, computational cost, and privacy-preserving), and aim to achieve highly efficient and quality guaranteed solutions for each of these problems. These four research aims will be evaluated based on their effectiveness, efficiency, and the practicality on specific biomedical datasets. Furthermore, this research will provide educational and research opportunities to both graduate and undergraduate students including students from underrepresented groups.This award reflects NSF's statutory mission and has been deemed worthy of support through evaluation using the Foundation's intellectual merit and broader impacts review criteria.
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DOI:
--
发表时间:
2020-10
期刊:
ArXiv
影响因子:
--
作者:
[Yufan Zhou;Changyou Chen;Jinhui Xu]
通讯作者:
Yufan Zhou;Changyou Chen;Jinhui Xu
DOI:
10.1109/cvpr52688.2022.00782
发表时间:
2022-06
期刊:
2022 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR)
影响因子:
--
作者:
[Zhenyi Wang;Li Shen;Tiehang Duan;Donglin Zhan;Le Fang;Mingchen Gao]
通讯作者:
Zhenyi Wang;Li Shen;Tiehang Duan;Donglin Zhan;Le Fang;Mingchen Gao
DOI:
--
发表时间:
2021-06
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Chunwei Ma;Ziyun Huang;Jiayi Xian;Mingchen Gao;Jinhui Xu]
通讯作者:
Chunwei Ma;Ziyun Huang;Jiayi Xian;Mingchen Gao;Jinhui Xu
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
37th International Conference on Machine Learning (ICML 2020
影响因子:
--
作者:
[Wang, D., Xiao, H., Devadas, S., Xu, J.]
通讯作者:
Xu, J.
DOI:
10.4230/lipics.socg.2016.34
发表时间:
2016-06
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hu Ding;Jing Gao;Jinhui Xu]
通讯作者:
Hu Ding;Jing Gao;Jinhui Xu
共 47 条
CAREER: Approximate Scheduling Algorithms via Mathematical Relaxations
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批准号:1844890
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项目类别:Continuing Grant
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资助金额:$50.0万
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财政年份:2019
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
AF:Small: Novel Geometric Techniques for Several Biomedical Problems
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批准号:1716400
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项目类别:Standard Grant
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资助金额:$45.18万
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财政年份:2017
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
AF: Small: Algorithmic Techniques for Several Geometric Problems Arising in Biomedical Imaging Applications
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批准号:1422324
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项目类别:Standard Grant
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资助金额:$47.03万
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财政年份:2014
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
III: Small: Algorithmic Techniques for Determining Alterations in the Patterns of Chromosome Spatial Organization inside the Cell Nucleus
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批准号:1422591
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项目类别:Continuing Grant
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资助金额:$50.0万
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财政年份:2014
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
III: Small: Algorithmic Tools for Spatial Positioning Studies in the Cell Nucleus
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批准号:1115220
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项目类别:Standard Grant
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资助金额:$50.0万
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财政年份:2011
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
III-CXT:Algorithmic Tools for Determining the Organization and Dynamics of the Cell Nucleus
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批准号:0713489
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项目类别:Continuing Grant
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2007
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
CAREER: Efficient Geometric Techniques for Problems Arising in Cardiovascular Intervention Procedures
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批准号:0546509
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项目类别:Continuing Grant
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资助金额:$40.78万
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财政年份:2005
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负责人:Jinhui Xu
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依托单位:
国内基金
海外基金
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昼夜节律性small RNA在血斑形成时间推断中的法医学应用研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位:
tRNA-derived small RNA上调YBX1/CCL5通路参与硼替佐米诱导慢性疼痛的机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2022
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负责人:张祥忠
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依托单位:
Small RNA调控I-F型CRISPR-Cas适应性免疫性的应答及分子机制
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批准号:32000033
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:林平
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依托单位:
Small RNAs调控解淀粉芽胞杆菌FZB42生防功能的机制研究
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批准号:31972324
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2019
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负责人:高学文
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依托单位:
变异链球菌small RNAs连接LuxS密度感应与生物膜形成的机制研究
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批准号:81900988
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:21.0万元
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批准年份:2019
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负责人:毛梦莹
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依托单位:
肠道细菌关键small RNAs在克罗恩病发生发展中的功能和作用机制
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批准号:31870821
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项目类别:面上项目
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资助金额:56.0万元
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批准年份:2018
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负责人:陈江宁
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依托单位:
基于small RNA 测序技术解析鸽分泌鸽乳的分子机制
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批准号:31802058
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:26.0万元
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批准年份:2018
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负责人:麻慧
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依托单位:
Small RNA介导的DNA甲基化调控的水稻草矮病毒致病机制
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批准号:31772128
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2017
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负责人:吴建国
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依托单位:
基于small RNA-seq的针灸治疗桥本甲状腺炎的免疫调控机制研究
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批准号:81704176
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2017
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负责人:赵继梦
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依托单位:
水稻OsSGS3与OsHEN1调控small RNAs合成及其对抗病性的调节
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批准号:91640114
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项目类别:重大研究计划
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资助金额:85.0万元
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批准年份:2016
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负责人:何祖华
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依托单位: