Genetic fine mapping and functional analysis of three chromosomal loci associated with resistance to severe falciparum malaria in humans
与人类抵抗严重恶性疟疾相关的三个染色体位点的遗传精细定位和功能分析
基本信息
- 批准号:239984794
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Research Grants
- 财政年份:2014
- 资助国家:德国
- 起止时间:2013-12-31 至 2016-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
A genetic fine mapping approach will be used to search for causal variants of three genetic loci on chromosomes 1p32, 2p22.3, and 16p22.2, which had been shown to influence the risk for severe malaria in humans. The genotyping will include of 25,000 SNP markers of the target regions. Additional SNPs, insertions and deletions will be imputed into the dataset. Logistic regression will be used in the assessment of association. Association signals will be confirmed in a second Ghanaian Study group of 3542 individuals. It is proposed to elucidate the biological function of the most associated variants by comparison with expression quantitative trait (eQTL) databases and by multiple empirical techniques in relevant tissues using context-specific assays.
一种遗传精细作图方法将用于寻找染色体1p32、2p22.3和16p22.2上三个遗传基因座的致病变异体,这些变异体已被证明会影响人类患严重疟疾的风险。基因分型将包括目标区域的25,000个SNP标记。其他SNP、插入和缺失将插补到数据集中。将使用逻辑回归评估相关性。关联信号将在由3542人组成的第二个加纳研究组中得到确认。建议通过与表达数量性状(eQTL)数据库的比较和使用上下文特异性测定在相关组织中的多个经验技术来阐明最相关变体的生物学功能。
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Human Genetic Factors and Resistance to Malaria
人类遗传因素和对疟疾的抵抗力
- DOI:10.1007/978-1-4614-8757-9_138-1
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Timmann C;Meyer CG
- 通讯作者:Meyer CG
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Dr. Christian Timmann其他文献
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