SNP-dependent splicing as an evolutionary mechanism to increase proteome variability

SNP 依赖性剪接作为增加蛋白质组变异性的进化机制

• 批准号: 25145398
• 负责人: Professor Dr. Jochen Hampe
• 金额: --
• 依托单位: Leibniz-Institut für Alternsforschung - Fritz-Lipmann-Institut e.V. (FLI)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2009-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/25145398?language=en
• 关键词: SNP; dependent; splicing; evolutionary; mechanism

Über 50.000 der HAPMAP Einzelbasenpolymorphismen (SNPs) sind in Sequenzmotiven mit potentieller Bedeutung für das Splicen (Akzeptoren, Donoren, exonische und intronische Spliceverstärkersequenzen) und können deshalb zu SNP-abhängigem Splicen führen. Schätzungen aus monogenen Erkrankungen besagen, dass bis zu 30% der phänotypisch relevanten Mutationen durch SNP-abhängigen Splicen wirken. Dieses SNP-abhängige Splicen könnte nicht nur für diese Erkrankungen von Bedeutung sein, sonder auch einen normalen (und effizienten) Mechanismus zur Erhöhung der inter-individuellen Proteomvariabilität darstellen. Im Rahmen des Projektes sollen erstens Prädiktionsverfahren für SNP-abhängiges Splicen entwickelt und experimentell validiert werden, zweitens einige verbesserte und hochdurchsatzfähige Methodik für die Prüfung SNP-abhängigen Splicens soll entwickelt werden und drittens solche ¿Splice-SNPs¿ auf evolutionäre Relevanz geprüft werden. Diese ¿evolutionäre Relevanz¿ wird über die Konservierung des SNPs oder des Splice-Musters zwischen Spezies etabliert und experimentell und mechanistisch geprüft um ¿SNP-abhängiges¿ Splicen als evolutionär wichtigen Prozess zu etablieren.

50.000 der HapMap Einzelbase Sind(SNPs)Sind in SequenzMotiven MIT电位器Bedeutung für das Splicen(Akzeptoren，Donoren，Exonische and Intronische Spliceverstärkerequenzen)and Können deshalb zu SNP-ABHänGigem Splicen führen.Schätzungen Aus mongenen Erkrankungen Besagen，dass bis zu 30%der phänotype isch en mutationen odch SNP-ABHängien Splicen wirken.SNP-ABHängie Splicen könnte Nicht Nur für diese Erkrankungen von Bedeutung sein，SNP-abhängie Splicen könnte nht nht nur für diese Erkrankungen von Bedeutung sein，SNP-abhängie Splicen könnte Net nht nur für diese Erkrankungen von Bedeutung sein，SNP-abhängie Splicen könnte Nicht Nur für diese Erkrankungen von Bedeutung sein，SNP-abhängie Splicen könnte Nicht nht nur für diese Erkrankungen von Bedeutung sein，Im Rahman des Projektes Sollen erstens Prädiktionsverfahren für SNP-abhängies Splicen entwickelt and explentell valideert wden，zweitens einige veresserte and hochduchsatzfägh e hochduchsatzfägh e hochduchsatzfäghe de Projektes Sollen SNP-ABHängien Splicens soll entwickelt werden and dritten solche？Splice-SNPs？auf进化äre geprüft.从Splice-Muster zwichen Spezies etabliert and machisistisch geprüft um[SNP-ABHängies？Splicen ALS Evolutionär wichtigen Prozess zu etablieren]到Splicen Are Rlevanz Rlevanz de Splicen de Sonservierung des Sonservierung des SNPs Des Splice？