Epigenomics of meiotic chromosomes driven by cell-cell transport of small RNAs in Poaceae species

禾本科物种中小RNA细胞间运输驱动的减数分裂染色体的表观基因组学

基本信息

  • 批准号:
    21H04729
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 26.62万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-05 至 2026-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

イネの葯で減数分裂特異的に発現する小分子RNAを中心とした細胞間シグナル因子による、細胞非自律的な減数分裂染色体のエピゲノム制御機構の解析を目的とする。2021年度は主に以下の3つの成果を得た。<1. 小分子RNAと結合するイネAGO4の解析> イネAGO4特異的抗体を用いて、AGO4に結合する小分子RNAを網羅的に解読し、減数分裂特異的小分子RNAである24nt phasiRNAのAGO4結合を確認した。また、ゲノム編集技術で作成したago4変異体を利用し、雄性減数分裂細胞(PMCs)を顕微鏡下で分取し、AGO4が減数分裂染色体のDNAメチル化に与える影響を網羅的に解析した。現在、上記2種類のデータについて情報解析を行なっている。<2. 細胞壁リプログラミング関連遺伝子の機能解析> 減数分裂前後のイネ葯は、PMCsを4層の体細胞層が包み込む構造をとる。減数分裂への移行を境に、PMCsおよびPMCsに接する体細胞層(タペート細胞(TCs))の細胞壁成分は、セルロースからカロースへと変化するが、その生物機能は未解明だった。ゲノム編集技術により、この時期のイネ葯で高発現するカロース合成酵素GSL5の変異体を作成して解析し、GSL5はイネ葯における減数分裂前後のカロース合成の大半を担うことを示した。また、GSL5依存的な葯へのカロース蓄積が、減数分裂の開始と進行における必須の役割を明らかにした。<3. 葯室のシン/アポプラスト輸送経路のイメージング解析> 植物細胞の細胞間シグナル経路は、原形質連絡を介したシンプラスト経路と、細胞外小胞などを介したアポプラスト経路に大別される。これまでの研究から、減数分裂特異的24nt phasiRNAのPMCs-TCs間シグナル伝達の可能性が示唆されている。2021年度は、イネ葯で透過電子顕微鏡観察を行うための技術を確立することができた。
The purpose of this study is to determine the molecular weight of the small molecule RNA in the center of the cell and the non-self-regulation of the cell in the center of the cell. The following three achievements will be awarded in 2021. < 1. Small molecule RNA binding sequence AGO4 analysis > small molecule RNA specific antibody assay, AGO4 assay combined with small molecule RNA network resolution, small molecule RNA DNA binding AGO4 with mitotic specificity. The technology of editing and editing is used to analyze the data of ago4 cells, male mitotic cells (PMCs), AGO4 chromosomes, DNA chromosomes, and shadow networks. At present, in the last two years, we have analyzed the situation in the last two years. < 2. The cell walls of the cells can be parsed and analyzed, and the cells of PMCs 4 cells can be analyzed before and after mitosis. The cell wall components of human body cells (TCs), cell wall components, cell wall components, cell wall components, In order to improve the performance of GSL5 biosynthesis enzymes, most of the synthetic enzymes were analyzed, and most of the synthetic enzymes were analyzed before and after mitosis. It is necessary to make a clean cut at the beginning of the war, the GSL5-dependent financial crisis, and the beginning of the mitotic cycle. < 3. The analysis of the plant cell intercellular pathway, the prototype link, the extracellular cell route, the extracellular cell route, and the extracellular cell route. The possibility of 24nt phasiRNA PMCs-TCs research and mitotic characteristics indicates that the possibility of reaching the level of mitosis is not satisfactory. In the year 2021, we will make sure that we are going to be able to make sure that we are going to make sure that we are going to

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
イネ葯室へのカロース高蓄積は減数分裂開始時期の制御に必須である
水稻花药室中胼胝质的大量积累对于控制减数分裂开始的时间至关重要。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    ソマシェカーハーシャ;三村真生;津田勝利;野々村賢一
  • 通讯作者:
    野々村賢一
正常な雄性減数分裂進行に必要なイネ葯室細胞間隙へのカロース多糖の高蓄積
正常雄性减数分裂进程所需的水稻花药室细胞间隙中胼胝质多糖的大量积累
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    ソマシェカーハーシャ;三村真生;津田勝利;野々村賢一
  • 通讯作者:
    野々村賢一
植物細胞遺伝研究室ホームページ
植物细胞遗传学实验室主页
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hamburg University(ドイツ)
汉堡大学(德国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Understanding the importance of cell-cell communication for plant meiosis using rice (Oryza sativa) as model organism
使用水稻(Oryza sativa)作为模型生物了解细胞间通讯对于植物减数分裂的重要性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Harsha Somashekar;Manaki Mimura;Tsuda Katsutoshi;Ken-Ichi Nonomura
  • 通讯作者:
    Ken-Ichi Nonomura
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三村真生;小野聖二郎;野々村賢一;イネ種間雑種胚乳におけるインプリントーム解析;野々村 賢一;野々村 賢一;小野聖二郎・野々村賢一
  • 通讯作者:
    小野聖二郎・野々村賢一
Post-transcriptional timing control of mitosis-meiosis transition
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三村真生;小野聖二郎;野々村賢一;イネ種間雑種胚乳におけるインプリントーム解析;野々村 賢一;野々村 賢一;小野聖二郎・野々村賢一;三村真生・小野聖二郎・野々村賢一;小野聖二郎・田中啓介・佐々木卓治・野々村賢一;澤田隼平・福永任吾・花俣 繁・小野聖二郎・木村成介・野々村賢一・来須孝光・朽津和幸;来須孝光・瀬良ゆり・花俣繁・坂本真吾・小野聖二郎・金古堅太郎・三井 悠大・北畑 信隆・三ツ井敏明・野々村 賢一・光田 展隆・朽津和幸;NONOMURA Ken-ichi;NONOMURA Ken-ichi
  • 通讯作者:
    NONOMURA Ken-ichi
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    福永任吾;澤田隼平;小川和准;花俣 繁;小野 聖二郎;野々村 賢一;来須孝光;朽津和幸
  • 通讯作者:
    朽津和幸
組み換えがホットなスポットを求めて
寻找重组热点
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三村真生;小野聖二郎;野々村賢一;イネ種間雑種胚乳におけるインプリントーム解析;野々村 賢一;野々村 賢一
  • 通讯作者:
    野々村 賢一
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控制水稻花药绒毡层组织减数分裂 siRNA 生物发生的 bHLH 转录因子网络
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    三村真生;小野聖二郎;野々村賢一;イネ種間雑種胚乳におけるインプリントーム解析;野々村 賢一;野々村 賢一;小野聖二郎・野々村賢一;三村真生・小野聖二郎・野々村賢一;小野聖二郎・田中啓介・佐々木卓治・野々村賢一
  • 通讯作者:
    小野聖二郎・田中啓介・佐々木卓治・野々村賢一

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