A move for sea subtropicalization: development of a marine organism map by environmental DNA analyses
A move for sea subtropicalization: development of a marine organism map by environmental DNA analyses
批准号:
21H04922
负责人:
井上 潤
金额:
$26.62万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2021-04-05 至 2026-03-31
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目的:研究船で収集した外洋の水に環境 DNA 解析を適用し、トカラ海峡周辺域に生息する生物の正確かつ網羅的な分布マップを作成する。実施計画:(A) 外洋での環境 DNA 採集。(B) 高精度な種判別ツールの開発。(C) 生物分布マップの作成。(D) 環境 RNA による産卵場の特定。実績:2021 年度から 2022 年度にかけて、トカラ海峡周辺域で研究船を利用して海水をサンプリングすることで、環境 DNA を採集した (A)。申請者は、高精度な種判別ツールを作成した。この結果を利用した生物分布マップの作成にも着手した (B, C)。さらに、サンゴを検出する環境 DNA プライマーを作成した (B)。環境 RNA による産卵場の特定に利用する核ゲノムからマーカーを選定するスクリプト ORTHOSCOPE* (https://github.com/jun-inoue/ORTHOSCOPE_STAR) を作成し論文として公開した (D)。
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Development of species‐specific multiplex real‐time PCR assays for tracing the small pelagic fishes of North Pacific with environmental DNA
开发物种特异性多重实时 PCR 检测方法,利用环境 DNA 追踪北太平洋小型中上层鱼类
DOI:
10.1002/edn3.275
发表时间:
2022
期刊:
Environmental DNA
影响因子:
--
作者:
[Wong Marty Kwok‐Shing, Nobata Shigenori, Ito Shin‐ichi, Hyodo Susumu]
通讯作者:
Hyodo Susumu
Temperature modulation alters the gut and skin microbial profiles of chum salmon (Oncorhynchus keta)
DOI:
10.3389/fmars.2022.1027621
发表时间:
2022-09
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Ghosh;M. Wong;S. Hyodo;Shuji Goto;K. Hamasaki]
通讯作者:
S. Ghosh;M. Wong;S. Hyodo;Shuji Goto;K. Hamasaki
Genomic analysis of a reef‐building coral, <i>Acropora digitifera</i> , reveals complex population structure and a migration network in the Nansei Islands, Japan
对造礁珊瑚<i>Acropora digitalifera</i>的基因组分析揭示了日本南西群岛复杂的种群结构和迁徙网络
DOI:
10.1111/mec.16665
发表时间:
2022
期刊:
Molecular Ecology
影响因子:
4.9
作者:
[Tsuchiya Kojin, Zayasu Yuna, Nakajima Yuichi, Arakaki Nana, Suzuki Go, Satoh Noriyuki, Shinzato Chuya]
通讯作者:
Shinzato Chuya
Species-specific patterns in spatio-temporal dynamics of juvenile chum salmon and their zooplankton prey in Otsuchi Bay, Japan, revealed by simultaneous eDNA quantification of diverse taxa from the same water samples.
通过对同一水样中不同类群的同时 eDNA 定量,揭示了日本大槌湾幼年鲑鱼及其浮游动物猎物的物种特异性时空动态模式。
DOI:
10.1111/fog.12631
发表时间:
2023
期刊:
Fisheries Oceanography
影响因子:
2.6
作者:
[Yuki Minegishi, Marty Kwok-Shing Wong, Mako Nakao, Yuichiro Nishibe, Aiko Tachibana, Yoo-Jun Kim, Susumu Hyodo]
通讯作者:
Susumu Hyodo
Commentary on ORTHOSCOPE: A Web Tool for Genome Comparisons
ORTHOSCOPE 评论:用于基因组比较的网络工具
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
Journal of Genetics and Genomes
影响因子:
--
作者:
[中山 雅紀,野村 芽久美, 藤代 一成, Inoue Jun]
通讯作者:
Inoue Jun
共 10 条
過敏性腸症候群の腸管透過性の亢進を制御する腸内細菌および宿主の病態解析
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批准号:22K07417
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2022
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负责人:井上 潤
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依托单位:
ミトコンドリアゲノム分析に基づく下位条鰭類高次系統の解明
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批准号:02J07304
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2002
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负责人:井上 潤
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依托单位:
海外基金