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Functional metabolites production in butyrate producing Faecalibacterium prausnitzii

产丁酸盐的普拉梭菌的功能性代谢产物

基本信息

批准号：
21J11100
负责人：
丹野広貴
金额：
$ 0.96万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-28 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本申請内容では、Faecalibacterium prausnitzii が種レベルで複数の系統群に分けられることに着目し、本菌が産生する抗炎症性タンパク質である Microbial Anti-Inflammatory Molecule (MAM) について、系統群ごとの抗炎症活性を観察していく予定であった。しかし、昨年度末に同様の研究結果が Auger らによって報告されたため [1]、昨年度に得られた結果を踏まえ、本菌群の分類のために 16S rRNA 遺伝子に代わる新規の遺伝子マーカーの検討を当該チームと共同で行った。まず乳酸菌やビフィズス菌の定量で用いられる 6 種類のハウスキーピング遺伝子を対象とし、86 菌株のゲノム中におけるコピー数の確認、相同性解析を行った。その結果、最終的に recA が本菌及びその類縁菌の分類と同定に適した遺伝子マーカーであると考えられた。一方で、recA は特定の系統群では群内における保存性が十分ではなく、定量のために必要となるそれぞれの系統群特異的プライマーの設計は難しいように思われた。そこで再度上述のハウスキーピング遺伝子の保存性について検討したところ、rpoA は recA と比較して系統群間の保存性が高く、特異的プライマーの設計に適した遺伝子であると考えられた。よって、rpoA 遺伝子を標的とした各系統群特異的なプライマーを設計し、各系統群に対する特異性の評価を合成 DNA や糞便抽出 DNA を用い行ったところ、各々の系統群特異的プライマーがいずれの系統群に対しても高い特異性を示す結果が得られた。以上の結果より、本菌及びその類縁菌の分類・同定には recA、定量には rpoA が適していることが明らかになり、本研究により Faecalibacterium 属細菌における新規の分類マーカーの確立及び定量法の開発が遂行された。[1] S. Auger et al. al., Intraspecific Diversity of Microbial Anti Inflammatory Molecule (MAM) from Faecalibacterium prausnitzii. Int J Mol Sci 23, (2022)

The present invention relates to Faecalibacterium prausnitzii, a Microbial Anti-Inflammatory molecule (MAM), and an anti-inflammatory activity of the Faecalibacterium prausnitzii. At the end of last year, the results of the same study were reported by Auger.[1] The results of last year's study were reported by Auger. The classification of this group was carried out by 16S rRNA gene. The quantitative analysis of lactic acid bacteria was carried out by comparing the number of strains in the six species and the identity analysis of 86 strains. The results of the study are as follows: A party, recA specific system group, within the group, preservation, quantitative, necessary, system group-specific design, difficult to think about The preservation of the genetic material is discussed in detail in the paper. The preservation of the genetic material is high and the design of the genetic material is special. For example, if a DNA fragment is found in a DNA fragment, the DNA fragment will be extracted from the DNA fragment. The above results show that the classification, identification and quantification of Faecalibacterium are the same. The new classification, identification and quantification of Faecalibacterium are established. [1] S. Auger et al. al., Intraspecific Diversity of Microbial Anti Inflammatory Molecule (MAM) from Faecalibacterium prausnitzii. Int J Mol Sci 23, (2022)