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Functional metabolites production in butyrate producing Faecalibacterium prausnitzii

产丁酸盐的普拉梭菌的功能性代谢产物

基本信息

批准号：
21J11100
负责人：
丹野広貴
金额：
$ 0.96万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-28 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本申請内容では、Faecalibacterium prausnitzii が種レベルで複数の系統群に分けられることに着目し、本菌が産生する抗炎症性タンパク質である Microbial Anti-Inflammatory Molecule (MAM) について、系統群ごとの抗炎症活性を観察していく予定であった。しかし、昨年度末に同様の研究結果が Auger らによって報告されたため [1]、昨年度に得られた結果を踏まえ、本菌群の分類のために 16S rRNA 遺伝子に代わる新規の遺伝子マーカーの検討を当該チームと共同で行った。まず乳酸菌やビフィズス菌の定量で用いられる 6 種類のハウスキーピング遺伝子を対象とし、86 菌株のゲノム中におけるコピー数の確認、相同性解析を行った。その結果、最終的に recA が本菌及びその類縁菌の分類と同定に適した遺伝子マーカーであると考えられた。一方で、recA は特定の系統群では群内における保存性が十分ではなく、定量のために必要となるそれぞれの系統群特異的プライマーの設計は難しいように思われた。そこで再度上述のハウスキーピング遺伝子の保存性について検討したところ、rpoA は recA と比較して系統群間の保存性が高く、特異的プライマーの設計に適した遺伝子であると考えられた。よって、rpoA 遺伝子を標的とした各系統群特異的なプライマーを設計し、各系統群に対する特異性の評価を合成 DNA や糞便抽出 DNA を用い行ったところ、各々の系統群特異的プライマーがいずれの系統群に対しても高い特異性を示す結果が得られた。以上の結果より、本菌及びその類縁菌の分類・同定には recA、定量には rpoA が適していることが明らかになり、本研究により Faecalibacterium 属細菌における新規の分類マーカーの確立及び定量法の開発が遂行された。[1] S. Auger et al. al., Intraspecific Diversity of Microbial Anti Inflammatory Molecule (MAM) from Faecalibacterium prausnitzii. Int J Mol Sci 23, (2022)

The contents of this application are as follows: 1. The contents of this application are as follows: Faecalibacterium prausnitzii, anti-inflammatory, Microbial Anti-Inflammatory Molecule (MAM), anti-inflammatory, anti-inflammatory and anti-inflammatory activity. The results of the study at the end of last year, the results of the Auger report at the end of last year, the results of the study last year, the results of the study at the end of last year and the results of the report at the end of last year. In the quantitative analysis of lactic acid bacteria, the number of bacteria in strain 86 was confirmed, and the same analysis line was used to determine the number of bacteria. The results of the test, the most advanced recA bacteria and their types of bacteria are classified into different categories. On the one hand, it is very important for the preservation of the system in the specific system of the recA system, and it is necessary to design the system of the special system of the system. Once again, the above-mentioned security information management systems, such as the preservation system, rpoA and recA systems, are highly conserved among the system groups, as well as those in the special design environment. The data set of each system, the synthesis of DNA, and the result of the high performance test of the system of each system, the rpoA cluster of each system, the synthesis of the DNA of each system, and the high performance of the system of each system. The results of the above results show that the classification of bacteria and bacteria is the same as that of recA, quantitative rpoA and quantitative analysis. In this study, Faecalibacterium belongs to the category of bacteria, the new classification of bacteria is established, and the quantitative method is used to perform the test. [1] S. Auger et al. Al., Intraspecific Diversity of Microbial Anti Inflammatory Molecule (MAM) from Faecalibacterium prausnitzii. Int J Mol Sci 23, (2022)