Structure formation of membranes in nonequilibrium
Structure formation of membranes in nonequilibrium
批准号:
21K03481
负责人:
野口 博司
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
非平衡下で生体膜がとる多様な形状変化、パターン形成を明らかにするのが本研究課題の目的である。今年度は、曲率誘導タンパク質および、その制御因子の膜への吸着、膜上の拡散が引き起こす現象について反応拡散方程式と膜変形をカップルさせた計算を行い、膜チューブ上を伝搬する興奮波について調べた。膜変形速度を波の伝搬速度に比べて速くしていくと、膜変形による興奮波の消失が起こるようになり、さらに速くすると、興奮波がまた伝播するようになることがあることを明らかにした。また、興奮波により、球状のコブが生じる条件や波の分裂が起こる条件も明らかにした。膜チューブのネットワークでは、膜分岐での波の分裂、衝突による波の対消滅が起こる。興奮波の消失による波の逆走など、膜変形による伝搬経路の変更も見られた。この他に、平衡、および、非平衡下での3成分系において、市松模様とカゴメ格子状の膜ドメインが形成する条件をメッシュレス膜模型を用いたシミュレーションにより、明らかにした。生体膜を挟む液体間で、曲率誘導タンパク質の濃度差がある場合、膜への吸着脱離を介した流れが生じる。また、膜チューブ形成における曲率誘導タンパク質の天然変性領域の影響も調べた。天然変性領域は、膜に自発曲率を与えるとともに、タンパク質間、および、タンパク質集合体間に斥力を与えることを明らかにした。また、全原子分子動力学計算により、3種類の超長鎖脂肪酸の二重膜内での振る舞いも明らかにした。
英文摘要
非平衡下で生体膜がとる多様な形状変化、パターン形成を明らかにするのが本研究課題の目的である。今年度は、曲率誘導タンパク質および、その制御因子の膜への吸着、膜上の拡散が引き起こす現象について反応拡散方程式と膜変形をカップルさせた計算を行い、膜チューブ上を伝搬する興奮波について調べた。膜変形速度を波の伝搬速度に比べて速くしていくと、膜変形による興奮波の消失が起こるようになり、さらに速くすると、興奮波がまた伝播するようになることがあることを明らかにした。また、興奮波により、球状のコブが生じる条件や波の分裂が起こる条件も明らかにした。膜チューブのネットワークでは、膜分岐での波の分裂、衝突による波の対消滅が起こる。興奮波の消失による波の逆走など、膜変形による伝搬経路の変更も見られた。この他に、平衡、および、非平衡下での3成分系において、市松模様とカゴメ格子状の膜ドメインが形成する条件をメッシュレス膜模型を用いたシミュレーションにより、明らかにした。生体膜を挟む液体間で、曲率誘導タンパク質の濃度差がある場合、膜への吸着脱離を介した流れが生じる。また、膜チューブ形成における曲率誘導タンパク質の天然変性領域の影響も調べた。天然変性領域は、膜に自発曲率を与えるとともに、タンパク質間、および、タンパク質集合体間に斥力を与えることを明らかにした。また、全原子分子動力学計算により、3種類の超長鎖脂肪酸の二重膜内での振る舞いも明らかにした。
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BarcelonaTech(スペイン)
巴塞罗那理工大学(西班牙)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Membrane domain formation induced by binding/unbinding of curvature-inducing molecules on both membrane surfaces
通过两个膜表面上的曲率诱导分子的结合/解除结合诱导膜域形成
DOI:
10.1039/d2sm01536f
发表时间:
2023
期刊:
Soft Matter
影响因子:
3.4
作者:
[Noguchi Hiroshi]
通讯作者:
Noguchi Hiroshi
Pattern Formation of Biomembrane Induced by Reaction-diffusion Dynamics of Curvature-inducing Proteins
曲率诱导蛋白的反应扩散动力学诱导的生物膜图案形成
DOI:
10.2142/biophys.62.338
发表时间:
2022
期刊:
Seibutsu Butsuri
影响因子:
--
作者:
[R. Mikami, T. Kikkawa, Y. Sasaki, H. Orihara, 野口博司,爲本尚樹]
通讯作者:
野口博司,爲本尚樹
天然変性領域を持つ曲率誘導タンパク質による膜変形
具有自然变性区域的曲率诱导蛋白导致膜变形
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[M. Ichioka, Y. Sera, T. Ueda, H. Adachi, 野口博司]
通讯作者:
野口博司
Excitable reaction-diffusion waves of curvature-inducing proteins on deformable membrane tubes
可变形膜管上曲率诱导蛋白的兴奋反应扩散波
DOI:
10.1103/physreve.106.024403
发表时间:
2022
期刊:
Physical Review E
影响因子:
2.4
作者:
[樹神克明、山内宏樹, 本田孝志、社本真一, 井川直樹、池田一貴, 大友季哉, N. Tamemoto and H. Noguchi]
通讯作者:
N. Tamemoto and H. Noguchi
共 21 条
非平衡下における生体膜での時空間パターン形成
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批准号:24K06973
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:野口 博司
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依托单位:
植物ポリケタイド生合成工学による分子多様性の創出
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批准号:19310145
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.23万
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财政年份:2007
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负责人:野口 博司
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依托单位:
脂質分子集合体の融合、分裂のダイナミクスの数値的研究
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批准号:00J02321
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2000
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负责人:野口 博司
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依托单位:
DNA鎖の折り畳みの統計力学―実験・理論両面からのアプローチ―
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批准号:97J01548
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:野口 博司
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依托单位:
マイクロマシン用強度設計指針の構築
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批准号:09875033
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:野口 博司
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依托单位:
薬用植物におけるフラボノイド類の区別的発現機構
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批准号:05680497
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1993
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负责人:野口 博司
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依托单位:
葉用植物におけるフラボノイド類生産の区別的発現
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批准号:04671286
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1992
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负责人:野口 博司
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依托单位:
薬用植物におけるフラボノイド類生産の基礎研究
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批准号:03807139
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1991
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负责人:野口 博司
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依托单位:
接着継手の破壊過程に基づく強度評価法の確立について
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批准号:03855015
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1991
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负责人:野口 博司
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依托单位:
連続観察に基づく,複合材料の静的及び疲労破壊過程モデルの検討
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批准号:01750067
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1989
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负责人:野口 博司
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依托单位:
走査電顕の微視的連続観察に基づく,複合材料の静的強度と疲労強度の関係の検討
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批准号:62750088
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1987
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负责人:野口 博司
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依托单位:
線形切欠き力学の低サイクル疲労, 低応力ぜい性破壊への応用
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批准号:60750092
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1985
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负责人:野口 博司
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依托单位:
カンゾウ(G.uralensis)培養組織のイソフラボノイド生成について
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批准号:58771582
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1983
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负责人:野口 博司
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依托单位:
酸素の安定同位体元素(^<18>O, ^<17>O)の生合成研究への応用
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批准号:56771034
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.45万
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财政年份:1981
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负责人:野口 博司
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依托单位:
Cassia torosa 組織培養を用いた生合成研究
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批准号:X00210----577879
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.5万
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财政年份:1980
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负责人:野口 博司
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依托单位:
海外基金