統計学的解析によるXFELバイオナノイメージングの深化
統計学的解析によるXFELバイオナノイメージングの深化
批准号:
21K03497
负责人:
城地 保昌
金额:
$2.75万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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生命現象を理解するには、構成要素である生体ナノ粒子が機能を発現している状態の過渡的な瞬間構造を捉えることが不可欠であり、超短パルスのXFELを利用したコヒーレント回折イメージング(CDI)は、そのポテンシャルをもつ。その実現のためには、試料以外からの背景散乱、ノイズ、検出器の不感領域等が含まれる実験データから確からしい試料の電子密度を再生する位相回復法の開発と、その信頼度の定量化が希求される。本研究では、これまで培ってきたCDIデータ解析技術を発展させ、統計学的観点の工夫を取り入れることで、次の2つのデータ解析手法開発を行う。(A) ベイズ推定に基づく背景散乱除去付位相回復法(B) イメージ画素毎に解析結果の信頼度を定量化する確率的電子密度解析法令和4年度は、令和3年度に開発した(A)の手法を、検出ノイズおよび背景散乱レベルを変えて計算した70Sリボソームの回折パターンに対して実行し、その適用範囲を調べた。現状のX線自由電子イレーザー施設SACLAで研究代表者等が行っている利用実験のS/N比が当初想定よりかなり低く、(A)の手法の適用範囲外であった。現状のSACLAの測定条件に対応する非常にS/N比の低い回折パターンから確度の高い位相回復を行うための手法を検討中である。並行して、(A)の手法の適用範囲内である回折パターンについて、(B)の解析法開発を開始した。具体的には初期乱数を変えて(A)の手法を適用した結果を統計的に解析し、画素毎の信頼度を定量化する検討を行った。
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Femtosecond X-ray Laser Reveals Intact Sea?Island Structures of Metastable Solid-State Electrolytes for Batteries
飞秒 X 射线激光揭示了电池用亚稳态固态电解质的完整海岛结构
DOI:
10.1021/acs.nanolett.1c04392
发表时间:
2022
期刊:
Nano Letters
影响因子:
10.8
作者:
[Suzuki Akihiro, Tanaka Hiromochi, Yamashige Hisao, Orikasa Yuki, Niida Yoshiya, Kimura Takashi, Tono Kensuke, Yabashi Makina, Ishikawa Tetsuya, Bessho Yoshitaka, Joti Yasumasa, Nishino Yoshinori]
通讯作者:
Nishino Yoshinori
X線自由電子レーザーによるソフトマテリアルの無損傷ナノイメージング
使用 X 射线自由电子激光对软材料进行无损伤纳米成像
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[西野 吉則, 鈴木 明大, 新井田 雅学, 別所 義隆, 城地 保昌]
通讯作者:
城地 保昌
X線自由電子レーザーによる分子レベルイメージングの実現に向けて
利用 X 射线自由电子激光器实现分子级成像
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[寺坂健一郎, 吉村信次, 斉藤稔, 城地保昌]
通讯作者:
城地保昌
DOI:
10.1364/optica.457352
发表时间:
2022-07-20
期刊:
OPTICA
影响因子:
10.4
作者:
[Nakano, Miki, Miyashita, Osamu, Tama, Florence]
通讯作者:
Tama, Florence
X線自由電子レーザー単粒子解析を使用した溶液中の金ナノ粒子の三次元構造決定
使用 X 射线自由电子激光单颗粒分析测定溶液中金纳米颗粒的三维结构
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中野 美紀, 宮下 治, 城地 保昌, 鈴木 明大, 西野 吉則, Florence Tama]
通讯作者:
Florence Tama
生体粒子の機能構造可視化のための高ノイズ耐性XFELデータ解析法の開発
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批准号:24K06986
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:城地 保昌
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依托单位:
実空間と逆空間で探る生体分子の集団運動と局所運動の相関
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批准号:20050008
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2008
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负责人:城地 保昌
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依托单位:
分子シミュレーションで探るABCトランスポーターの膜輸送動力発生機構
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批准号:19042005
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2007
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负责人:城地 保昌
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依托单位:
構造変化における蛋白質のエネルギー地形階層性と水和の役割
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批准号:18031006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2006
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负责人:城地 保昌
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依托单位:
蛋白質中性子散乱スペクトルの計算機実験を援用する測定法および解析法の提案
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批准号:15740265
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2003
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负责人:城地 保昌
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依托单位:
海外基金