Molekulare Epidemiologie und Evolution von Methicillin-resistenten Staphylococcus aureus (MRSA)

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的分子流行病学和进化

• 批准号: 29160763
• 负责人: Professor Dr. Alexander Mellmann
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Hygiene
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2005-12-31 至 2008-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/29160763?language=en
• 关键词: Molekulare; Epidemiologie; und; Evolution; von

Staphylococcus aureus ist weltweit der häufigste Erreger nosokomialer Infektionen. Umfangreiche Populationsanalysen zeigten verschiedene Mechanismen bei der Weitergabe von genetischen Informationen. Bis vor kurzem wurde von einer vertikalen Verbreitung (Klonalität) von genetischen Informationen ausgegangen, neue Gesamtgenomanalysen deuten aber auf eine große genetische Plastizität hin, die auf einem ausgedehnten horizontalen Gentransfer (Rekombination) hinweisen. In diesem Antrag soll die Fragestellung bearbeitet werden, wie sich im zeitlichen Verlauf verschiedene Regionen innerhalb des S. aureus Genoms verändern. Die Beantwortung dieser Fragen ist von grundlegender Bedeutung für das Verständnis der Ausbreitung hochvirulenter und resistenter S. aureus Stämme, aber auch für die Analyse von Infektketten und den Verlauf persistierender Infektionen. Dazu sollen zunächst neben essentiellen Genregionen (z.B. Haushaltsgene) hochvariable und der Rekombination unterliegende Genregionen (z.B. set Gene, kodierend für Staphylokokken Exotoxinähnliche Proteine) von ausgewählten klinischen Methicillin-resistenten S. aureus Isolaten untersucht werden. Die hochvariablen Genregionen werden mittels DNASequenzanalysen eingehend charakterisiert und anschließend mit den Ergebnissen etablierter Typisierungsmethoden der essenziellen Genregionen (z.B. Multilocus Sequenztypisierung, MLST; Spa-Typisierung) verglichen. Daraus sollen Evolutionsmodelle der hochvariablen Genregionen entwickelt, mittels bioinformatischer Anwendungen simuliert und neue Algorithmen für Verwandtschaftsanalysen entwickelt werden. Diese Modelle werden dann durch in vitro-Selektionsversuche evaluiert und mit dem auf MLST-Daten basierenden Evolutionsmodell verglichen, um die Entwicklung dieser hochvariablen Regionen besser zu verstehen.

金黄色葡萄球菌是一种严重的非传染性疾病。人口分析在遗传学信息的微观层面上揭示了遗传学机制。在遗传学信息的垂直传播（Klonalität）的基础上，新的遗传学基因分析可以在一个大的遗传学可塑性基础上进行，也可以在一个水平的基因转移（重组）基础上进行。在这场斗争中，我们必须承担韦尔登，就像在当时的欧洲地区一样。aureus Genoms verändern.这位女性的行为是为了更好地理解和抵制S。金黄色葡萄球菌，但也可用于感染分析和持续感染。Dazu sollen zunächst neben essentiellen Genregionen（z.B. Haushaltsgene）hochvariable und der Rekombination unterliegende Genregionen（z.B. set Gene，kodierend für Staphylocokken Exotoxinähnliche Proteine）von ausgewählten klinischen Methicillin-resistenten S.金黄色葡萄球菌本文介绍了用DNASequenzanalysen方法分析高变量Genregionen韦尔登的特征和应用，并建立了Genregionen的分类方法（z.B.多位点序列分型。通过解决遗传变异的进化模型，我们可以对生物信息学进行模拟，并为韦尔登分析提供新的工具。该韦尔登可通过体外选择性评价和基于MLST数据的进化模型进行评价，以更好地了解该区域的发展变化。