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新規トランスポゾン転移制御機構の解明

阐明新型转座子易位控制机制

基本信息

批准号：
21K06008
负责人：
伊藤秀臣
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06008/
关键词：
トランスポゾンエピジェネティクスシロイヌナズナ

项目摘要

トランスポゾンや反復配列は一般的にDNAのメチル化やヒストン修飾によりヘテロクロマチン化され、転写が抑制されており、転移に必要なタンパク質を発現できないことから転移が起こらない状態が保たれている。しかしながら、我々の先行研究の結果から、ONSENの転移効率と転移頻度は、転写レベルと必ずしも相関しているわけではない結果を得た(Hayashi et al. 2020)。このことから、ONSENの転移制御には、転写レベルでの制御以外に転移制御に関わる重要な因子が存在することが示唆された。そこで，未知の転移制御機構が存在するという着想に至り、実際に変異体スクリーニングを行った結果、ONSENの転写レベルは野生型と変わらないが世代を超えた転移が観察される変異体screen1を同定した。この変異体は、既知の抑制的エピジェネティック修飾に関与する遺伝子の変異体とは異なり、ONSENの転写レベルは野生型と変わらない。このことは、ONSENの転移をゲノムの挿入レベルで制御する新規の制御機構の存在を示唆している。本研究では、シロイヌナズナの変異体を用いてトランスポゾンの新規の転移制御機構を解明することが目的である。ONSENの転移制御に関与する新規の因子を同定するために、多数の原因候補遺伝子を選出して、サザンブロットにより転移解析を行った。しかし、全ての変異体でONSENの転移が検出できなかった。今までの結果から、screen1 の原因因子は 5.3Mbから8.9Mbまでの領域にあることがわかった。そのため、48時間の熱ストレスをかけた5.3Mbから8.9Mbまでの領域にある17個原因遺伝子を用いてTED-seqによりONSENの転移を検出する予定である。

In addition to the above, it is also necessary to modify the DNA structure and DNA structure in order to prevent the occurrence of DNA damage. The results of previous studies on ONSEN were obtained by comparing the shift rate and shift frequency of ONSEN with those of previous studies (Hayashi et al. 2020). The key factors that affect the migration control of ONSEN are: For example, unknown migration control mechanisms exist in the wild type, and in the wild type. This variant is known to be inhibited by a gene that is modified by a gene that is different from a wild type. This is the first time that ONSEN has been transferred to China. This study aims to clarify the mechanism of the new regulation of migration control in the application of migration control. ONSEN's migration control and new regulation factors are the same, and most of the cause candidates are selected and analyzed. The change of ONSEN can be seen everywhere. The cause factor of screen1 is 5.3Mb and 8.9Mb. 48 hours of hot weather from 5.3Mb to 8.9Mb in the field of 17 reasons for the use of TED-seq from ONSEN.