新規トランスポゾン転移制御機構の解明
新規トランスポゾン転移制御機構の解明
批准号:
21K06008
负责人:
伊藤 秀臣
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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トランスポゾンや反復配列は一般的にDNAのメチル化やヒストン修飾によりヘテロクロマチン化され、転写が抑制されており、転移に必要なタンパク質を発現できないことから転移が起こらない状態が保たれている。しかしながら、我々の先行研究の結果から、ONSENの転移効率と転移頻度は、転写レベルと必ずしも相関しているわけではない結果を得た(Hayashi et al. 2020)。このことから、ONSENの転移制御には、転写レベルでの制御以外に転移制御に関わる重要な因子が存在することが示唆された。そこで,未知の転移制御機構が存在するという着想に至り、実際に変異体スクリーニングを行った結果、ONSENの転写レベルは野生型と変わらないが世代を超えた転移が観察される変異体screen1を同定した。この変異体は、既知の抑制的エピジェネティック修飾に関与する遺伝子の変異体とは異なり、ONSENの転写レベルは野生型と変わらない。このことは、ONSENの転移をゲノムの挿入レベルで制御する新規の制御機構の存在を示唆している。本研究では、シロイヌナズナの変異体を用いてトランスポゾンの新規の転移制御機構を解明することが目的である。ONSENの転移制御に関与する新規の因子を同定するために、多数の原因候補遺伝子を選出して、サザンブロットにより転移解析を行った。しかし、全ての変異体でONSENの転移が検出できなかった。今までの結果から、screen1 の原因因子は 5.3Mbから8.9Mbまでの領域にあることがわかった。そのため、48時間の熱ストレスをかけた5.3Mbから8.9Mbまでの領域にある17個原因遺伝子を用いてTED-seqによりONSENの転移を検出する予定である。
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Investigating a novel regulator of heat-responsive retrotransposons in Arabidopsis thaliana.
研究拟南芥热响应反转录转座子的新型调节剂。
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[牛小蛍, 竹平佳菜子, 加藤敦之, 伊藤秀臣]
通讯作者:
伊藤秀臣
Diversity and strategies of environmental stress-responsive transposons in plants
植物环境胁迫响应转座子的多样性及策略
DOI:
10.1266/ggs.97.167
发表时间:
2022
期刊:
Genes & Genetic Systems
影响因子:
1.1
作者:
[Ito Hidetaka]
通讯作者:
Ito Hidetaka
Search for novel transcriptional regulators of heat-activated retrotransposons in Arabidopsis thalian
寻找拟南芥热激活反转录转座子的新型转录调控因子
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[牛 小蛍, 竹平 佳菜子, 加藤 敦之, 伊藤 秀臣]
通讯作者:
伊藤 秀臣
DDR複合体による熱活性型レトロトランスポゾンの制御機構
DDR复合体对热激活反转录转座子的控制机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[牛 小蛍, 陳 露, 加藤 敦之, 伊藤 秀臣]
通讯作者:
伊藤 秀臣
シロイヌナズナにおける熱活性型レトロトランスポゾンの新規転移制御因子の探索
寻找拟南芥热激活反转录转座子的新型转座调节因子
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[牛小蛍, 竹平佳菜子, 加藤敦之, 伊藤秀臣]
通讯作者:
伊藤秀臣
Identification and functional analysis of novel transposition regulators of transposons
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批准号:21KK0263
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
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资助金额:$8.32万
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财政年份:2022
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负责人:伊藤 秀臣
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依托单位:
海外基金