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オルガネラ間コンタクトを担う低親和性タンパク質複合体の溶液NMR解析

对负责细胞间接触的低亲和力蛋白质复合物进行溶液核磁共振分析

基本信息

批准号：
21K06047
负责人：
古板恭子
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

小胞体膜貫通タンパク質Vesicle-associated membrane protein Associated Protein (VAP)は小胞体と他のオルガネラあるいは細胞膜とのコンタクトサイトにおけるタンパク質間相互作用を担うタンパク質である。VAPのN末端側にあるMajor Sperm Protein (MSP)ドメイン(VAPMSP)は、FFAT-likeモチーフと呼ばれる非常に多様な配列を結合することが知られている。VAPMSPとFFAT-likeモチーフの相互作用は様々な細胞機能に重要であることが示されている。しかし、VAPMSPがどのように多様な配列を認識しているのかは不明である。本年度は13C標識VAPMSPと非標識のFFAT-likeモチーフを含むペプチドからなる試料を用い、溶液NMRを用いて13CフィルターNOESY測定を行った。この測定では、理論的には標識分子と非標識分子の間で互いに近接した水素原子がある場合にのみ信号が観測される。測定の結果いくつか信号が確認でき、VAPMSPとペプチドは結合していると考えられた。また、化学シフトの帰属ができれば原子レベルでの分子間相互作用の情報が得られると考えられた。次にVAPがFFAT-likeモチーフが相互作用する際に液液相分離（LLPS）する可能性があるため、VAPMSPがin vitroでLLPSするかどうかを検証した。その結果、いくつかの条件下でLLPSすることが確認できた。LLPS形成条件の検討により、特に酸性低温条件でLLPSしやすい傾向があることが分かった。

Vesicle-associated membrane protein Associated Protein (VAP) is a protein associated with vesicle-associated membrane protein. The N-terminal side of VAP contains Major Sperm Protein (MSP), FFAT-like protein (VAPMSP) and very diverse protein sequences. VAPMSP and FFAT-like interactions are important for cell function. VAPMSP is not clear. This year, 13C labeled VAPMSP and FFAT-like NMR were used to determine the sample and solution NMR. This measurement is based on the theory of molecular identification and molecular non-identification. The result of the measurement is that the signal is confirmed, and the VAPMSP is selected. Information on molecular interactions in the chemical world is available. Second, the possibility of liquid-liquid phase separation (LLPS) between VAP and FFAT-like interaction, and the possibility of VAPMSP in vitro with LLPS The result of the test is that the test is confirmed under the condition of LLPS. LLPS formation conditions are discussed in detail, especially under acidic and low temperature conditions.