非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構

非通道蛋白膜集成器件YidC的分子机制

• 批准号: 21K06053
• 负责人: 千葉 志信
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyoto Sangyo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06053/
• 关键词: YidC; タンパク質膜挿入; 膜タンパク質; タンパク質膜組込

膜タンパク質を膜に組み込む膜組込装置には、孔(チャネル)を持つタイプと持たないタイプがある。チャネル型膜組込装置の分子機構の理解は比較的すすんでいるが、非チャネル型タンパク質膜組込装置の分子機構はその多くが不明である。本研究では、非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構と生理機能を理解するために、変異解析や阻害剤のスクリーニングを行うことを計画した。2022年度は、昨年度に引き続き、YidCの阻害剤の探索をさらに進めた。候補化合物について、YidCの変異株に対する効果を見たところ、いくつかの阻害剤は、その阻害効果を喪失した。このことから、これらの阻害剤の直接のターゲットがYidCであることが強く示唆された。一方で、昨年度から行っている、枯草菌YidCの新規基質の探索をさらに進めた。枯草菌膜タンパク質とMifMとを融合した各種レポーターを作成し、その膜挿入のSpoIIIJ依存性を検討し、結果として、複数のYidC基質と思われるものを同定した。さらに、これらの膜挿入がSpoIIIJの溝の塩基性残基に依存している事が示された。このことは、SpoIIIJの溝の塩基性が普遍的に重要であることを示している。一方、各基質間で、膜挿入に重要な性質がそれぞれ異なることも明らかになった。このことから、YidCは、基質特異的な相互作用も合わせてタンパク質の膜挿入を促進していることが示唆された。これらについて、必要なデータを揃え、論文としてまとめ、投稿した。YidCの細胞質領域の変異解析をより詳細に進めている。

有两种类型的膜整合设备将膜蛋白纳入膜中，有些具有孔（通道）的类型，而其他类型则没有。虽然了解通道型膜整合设备的分子机制相对先进，但非通道蛋白膜整合装置的许多分子机制尚不清楚。在这项研究中，我们计划进行突变分析和筛选抑制剂，以了解非通道蛋白膜整合装置YIDC的分子机制和生理功能。与去年一样，在2022年，我们继续探索YIDC抑制剂。当我们研究候选化合物对Yidc突变菌株的影响时，一些抑制剂失去了抑制作用。这强烈表明YIDC是这些抑制剂的直接靶标。另一方面，我们继续探索自去年以来一直在做的枯草芽孢杆菌的新底物。准备了各种记者将枯草芽孢杆菌膜蛋白与MIFM融合在一起，并研究了膜插入对SPOIIIJIJ的依赖性，因此，确定了多个可能的Yidc底物。此外，表明这些膜插入取决于Spoiiij凹槽中的基本残基。这表明Spoiiij中的凹槽的碱性普遍重要。另一方面，也已经揭示了膜插入的特性在底物之间有所不同。这表明YIDC还促进蛋白质的膜插入以及底物特异性相互作用。收集这些数据并将其编译成论文，并提交。更详细地对YIDC的细胞质区域进行突变分析。

项目成果

真正細菌における翻訳アレストの解析と応用

真细菌翻译停滞的分析及应用

• 发表时间: 2022
• 作者: 藤原圭吾;千葉志信
• 通讯作者: 千葉志信

千葉研究室HP

千叶研究所HP

微生物における新規翻訳品質管理機構 RQC の分子メカニズムの解明

阐明微生物中一种新型翻译质量控制机制 RQC 的分子机制

• 发表时间: 2022
• 作者: 高田啓;藤原圭吾;Gemma C. Atkinson;Vasili Hauryliuk;千葉 志信
• 通讯作者: 千葉 志信

TnDR 法による新生鎖の動的挙動のプロテオームワイドな検出

使用 TnDR 方法对新生链的动态行为进行全蛋白质组检测

• 发表时间: 2022
• 作者: 藤原圭吾;千葉志信
• 通讯作者: 千葉志信

非チャネル型タンパク質膜挿入装置YidCの解析

非通道蛋白膜插入装置YidC分析

• 发表时间: 2023
• 作者: 古板恭子;平岡万里菜;花田賢太郎;藤原敏道;児嶋長次郎;千葉志信
• 通讯作者: 千葉志信