哺乳類のDNA複製タイミング制御におけるゲノムとエピゲノムの機能的リンク
基因组和表观基因组在控制哺乳动物 DNA 复制时间方面的功能联系
基本信息
- 批准号:21K06129
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The eukaryotic genome is organized into eu- or hetero-chromatin domains, the former is gene-rich and transcriptionally active, while the latter is gene-poor and transcriptionally inactive. Eu- or hetero-chromatin are also analogous to A or B compartments, calculated from the PC1 (primary component 1) value of the eigenvector of the Hi-C (a method for chromatin conformation capture) matrix. During S phase, A compartments replicate early while B compartments replicate late. It is, however, not understood if A/B compartmentalization and early/late replication timing is mechanistically linked.
真核生物的基因组被组织成真染色质或异染色质结构域,前者是基因丰富和转录活性,而后者是基因贫乏和转录失活。Eu-或异染色质也类似于A或B区室,根据Hi-C(染色质构象捕获方法)矩阵的特征向量的PC 1(主要成分1)值计算。在S期,A区室复制早,而B区室复制晚。然而,目前还不清楚A/B区室化和早期/晚期复制时间是否存在机械联系。
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Efficient de novo assembly and modification of large DNA fragments
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- DOI:10.1007/s11427-021-2029-0
- 发表时间:2021-12-16
- 期刊:
- 影响因子:9.1
- 作者:Jiang, Shuangying;Tang, Yuanwei;Dai, Junbiao
- 通讯作者:Dai, Junbiao
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- 期刊:
- 影响因子:4
- 作者:Sharif,Jafar;Koseki,Haruhiko;Parrish,Nicholas F.
- 通讯作者:Parrish,Nicholas F.
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