LTR型レトロトランスポゾンの配列特異型転移特性の進化機構の解明

阐明LTR型逆转录转座子序列特异性转座特征的进化机制

• 批准号: 21K06284
• 负责人: 河邊 昭
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Kyoto Sangyo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06284/
• 关键词: シロイヌナズナ; トランスポゾン; 動原体; アブラナ科

アブラナ科植物におけるトランスポゾンファミリーの存在様式の調査をおこなった。シロイヌナズナ属で見つかった動原体領域をターゲットとするトランスポゾンファミリーについて、アブラナ科の植物を対象として、進化解析をおこない、類似の配列が広く存在することを確認していたが、このうちいくつかに関して、コピーのゲノム上での分布を調査した。動原体領域とそうでない領域に存在するグループが共存種を見出した。一部は次世代シークエンスによって新規転移を同定した。動原体をターゲットとする転移特性がアブラナ科の中では祖先型であることがはっきりとし、その中で転移特性が変化したグループが独立に出現していることがわかってきた。今後、系統間の違いや発現解析をしていくことで動原体をターゲットとする機構の進化様式と分子機構の解明を目指したい。またシロイヌナズナを材料として、これまでに研究が進んでいた系統とは別の系統を利用して新たなグループを調査している。すでに系統間で挿入位置が異なる配列が多くみられるグループや、最近コピー数を増やしたと思われるグループを複数見出している。これらの系統について低メチル化剤処理や低メチル化変異の導入によるトランスポゾンの活性化を試みたところ、新規転移を確認することができた。現在までに新規転移は少数しか確認できていないので、今後はさらに世代更新を進めることに加えてデータ量を増やすことで転移可能なコピーの特定、その特性の調査をおこなっていきたいと考えている。

The investigation of the existence of the plant species in the family of To investigate the distribution of plant species, evolutionary analysis, and similar species in the field of zooplasma. The origin of the animal is the existence of the species. The new rules for the next generation are set. The first step is to create a new environment. In the future, the analysis of the interaction between systems and the evolution of molecular mechanisms For example, if you want to study the material, you should study the system and make use of it. The number of entries in the system varies from system to system, and the number of entries in the system varies from system to system. This system is designed to reduce the number of users, and reduce the number of users. The new regulations are now being revised to confirm the new regulations, and the new regulations will be updated in the future. The new regulations will be revised to increase the number of new regulations.

项目成果

琵琶湖集水域の環境メタロミクス(10) 琵琶湖岸の希少植物タチスズシロソウ ―環境要因が個体数に与える影響―

琵琶湖流域的环境金属学 (10) 琵琶湖畔的珍稀植物立铃紫草 - 环境因素对人口的影响 -

• 发表时间: 2022
• 期刊: 金属
• 作者: Ueki Noriko;Isu Atsuko;Kyuji Ayaka;Asahina Yuma;So Satoaki;Takahashi Rina;Hisabori Toru;Wakabayashi Ken-ichi;吉山浩平・小野夏実・宮村 弘・河邊 昭・原田 英美子
• 通讯作者: 吉山浩平・小野夏実・宮村 弘・河邊 昭・原田 英美子

オルガネラゲノムのRNAエディティングに関わるシロイヌナズナのPPR遺伝子の機能喪失型変異

拟南芥 PPR 基因的功能缺失突变参与细胞器基因组的 RNA 编辑

• 发表时间: 2021
• 作者: Tatsuki Yamazoe;Shota Kawasaki;Hiroka Katsube;Yoshihiro H. Inoue;河邊昭，西田早希，降旗初佳
• 通讯作者: 河邊昭，西田早希，降旗初佳