マメ科ハギ属の在来・外来集団の識別と分類学的再検討へのMIG-seq法の適用

应用 MIG-seq 方法对豆科豆科植物本土和外来种群进行鉴定和分类学复审。

• 批准号: 21K06322
• 负责人: 根本 智行
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Ishinomaki Senshu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06322/
• 关键词: マメ科; ハギ属; ミヤギノハギ; ビッチュウヤマハギ; ケハギ; MIG-seq解析; 分類学; 帰化種

1．野外調査による標本およびDNA解析試料の収集：研究代表者が調査および収集を行った。まず、9月7日-14日に、ミヤギノハギ（広義）および近縁種の集団の試料および標本の収集を目的に、試料が全く入手できていない四国（香川県、徳島県、高知県）で現地調査を行った。次に、9月17、18日にミヤギノハギ（広義）の亜種であるケハギの分布北限である山形県において標本および試料の収集を行った。さらに、令和3年度に時期が早すぎて花期の標本と同時にDNA解析試料を採取できなかったサツマハギの収集を目的に、10月6日～14日に鹿児島県薩摩川内市（甑島）および南さつま市（大浦町・笠沙町）で調査を行った。2. MIG-seq解析：上記の調査で収集したハギ属271個体に、以前アメリカ合衆国や韓国で収集した17個体の試料も加えて全DNAを抽出した後、共同研究者がMIG-seq解析を行っている。すでに解析結果の得られている東北・北陸・東海・近畿・中国・九州地方の試料の系統解析を行い、得られた系統樹と標本との照合を行い、以下のことが判明した。(1)ミヤギノハギ（広義）の亜種であるタイワンハギ、ケハギ、ミヤギノハギ、ビッチュウヤマハギはそれぞれ系統的にまとまる。また、系統樹はタイワンハギ、ビッチュウヤマハギ、ケハギは別種とすべきことを示唆した。また、ミヤギノハギは、他の栽培品種とともに、ビッチュウヤマハギおよびケハギと系統的なネットワークを形成しており両種の雑種起源である可能性が示唆された。(2)新潟県および京都府の各１地点で、ビッチュウヤマハギに形態が類似し系統的にもまとまり、かつ、ヤマハギやマルバハギと系統的につながる集団が見つかった。しかし、葉形がビッチュウヤマハギやヤマハギ、マルバハギとは異なり、国内に該当する既知の分類群や集団が見つからず、中国などの国外から導入された集団である可能性がある。

1. Field investigation による specimen およびDNA analysis sample collection: Research representative が investigation および collection を row った. ま ず, September 7-14 に, ミ ヤ ギ ノ ハ ギ (hiroo righteousness) お よ び nearly try の set 団 の sample お よ び specimen の 収 に を purpose, sample が with full く で き て い な い bric (sichuan island 県 県, Howard, kochi 県) で in situ survey line を っ た. に, on September 17, 18 に ミ ヤ ギ ノ ハ ギ (hiroo righteousness) の 亜 kind で あ る ケ ハ ギ の distribution north limit で あ る yamagata 県 に お い て specimen お よ び sample の 収 row っ を た. さ ら に period, make and 3 year に が early す ぎ て flowering の specimens と に DNA analytic sample at the same time を take で き な か っ た サ ツ マ ハ ギ の 収 に を purpose, October 6 ~ 14 に deer island where 県 samoyed chuan city (retort island) within お よ び south さ つ ま city (big pu town, dai li sha town) で survey line を っ た. 2. MIG - seq analytic: written の survey で 収 set し た ハ ギ genera and 271 individual に, before ア メ リ カ や United States South Korea で 収 set し た 17 individual の sample も plus え て full DNA を spare し た, common the researchers が MIG - seq parsing line を っ て い る. Analytical results ら の す で に れ て い る northeast, hokuriku, the east China sea, kinki, where China kyushu の sample の system was analytical を い, ら れ た system tree と specimen と の according to line を い, the following の こ と が.at し た. (1) ミ ヤ ギ ノ ハ ギ (hiroo righteousness) の 亜 kind で あ る タ イ ワ ン ハ ギ, ケ ハ ギ, ミ ヤ ギ ノ ハ ギ, ビ ッ チ ュ ウ ヤ マ ハ ギ は そ れ ぞ れ system に ま と ま る. ま た, tree は タ イ ワ ン ハ ギ, ビ ッ チ ュ ウ ヤ マ ハ ギ, ケ ハ ギ は other と す べ き こ と を in stopping し た. ま た, ミ ヤ ギ ノ ハ ギ は, he の cultivars と と も に, ビ ッ チ ュ ウ ヤ マ ハ ギ お よ び ケ ハ ギ と system な ネ ッ ト ワ ー ク を form し て お り struck a の 雑 origins で あ が る possibility in stopping さ れ た. (2) the niigata 県 お よ び Kyoto の each 1 place で, ビ ッ チ ュ ウ ヤ マ ハ ギ に form が し system like に も ま と ま り, か つ, ヤ マ ハ ギ や マ ル バ ハ ギ と system に つ な が る set 団 が see つ か っ た. し か し, leaf shape が ビ ッ チ ュ ウ ヤ マ ハ ギ や ヤ マ ハ ギ, マ ル バ ハ ギ と は different な り, domestic に should す る already know の taxa や set 団 が see つ か ら ず, China な ど の abroad か ら import さ れ た set 団 で あ る possibility が あ る.

项目成果

MIG-seq法を用いたマメ科ハギ属の系統解析

使用 MIG-seq 方法对豆科 Lamium 属进行系统发育分析

• 发表时间: 2023
• 作者: Aibekova;L.;Keller;R.A.;Katzke;J.;Allman;D.M.;Hita Garcia;F.;Labonte;D.;Narendra;A. & Economo;E.P.;根本智行・松尾 歩・廣田 峻・陶山佳久
• 通讯作者: 根本智行・松尾 歩・廣田 峻・陶山佳久