新規抗生物質の標的分子探索を目指した病原菌の情報伝達経路プロテオームデータの創出
新規抗生物質の標的分子探索を目指した病原菌の情報伝達経路プロテオームデータの創出
批准号:
21K06455
负责人:
木下 恵美子
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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近年,病原菌の環境適応,薬剤耐性などに関わる情報伝達経路(2成分伝達経路)を構成するヒスチジンキナーゼ(HK)の阻害剤の開発が国内外で進められている。その経路に含まれる一連のタンパク質,例えば,HK とペアをなすもう一つの成分であるレスポンスレギュレータ(RR)も新規抗生物質の標的となりうるが,HK とRRは化学的に不安定なヒスチジンやアスパラギン酸のリン酸化を介して情報伝達経路を行うため,質量分析による解析が適用できず,経路全体を俯瞰するプロテオームデータがない。本研究では「フォスタグ」を用いた不安定リン酸化タンパク質の解析技術を利用し,細菌のシグナル活性化と外部環境因子との関連を網羅的に解析する。そうして蓄積したデータから分子間相互作用や情報伝達機構のクロストークなどが明らかになり,阻害剤などの新規抗生物質の標的分子が浮かび上がるようになることを目的とする。昨年度は,腸管出血性大腸菌など強い病原性の株が知られる,大腸菌の2成分情報伝達経路 を再現した擬似的な大腸菌を作成することを目標とした。大腸菌には,遺伝子がタンデムに並び機能的なペアと考えられる HK とRRが 29 組あるので,それら計 58 遺伝子をクローニングした。検討のため,1ペアについて HKと RR を互いに異なる複製開始点を持つ2種類の発現プラスミドにそれぞれサブクローニングした。8種類の発現プラスミドを用いて,良好に発現する組み合わせを検討したところ,3組の組み合わせで,HK とRRの共発現が可能であった。今年度は,他のHK とRRについても同様に発現プラスミドにサブクローニングを行った。良好に発現する遺伝子と発現できない遺伝子があり,できるだけ多くの遺伝子が発現できるよう検討を続けている。また,病原性発現に関わるHKの発現に伴うトランスクリトーム変化を調べるRNAseqを計画している。
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DOI:
10.1016/j.inoche.2022.110221
发表时间:
2022-11
期刊:
Inorganic Chemistry Communications
影响因子:
3.8
作者:
[Yoshimi Ichimaru;Koichi Kato;Rina Nakatani;K. Sugiura;H. Mizutani;Emiko Kinoshita-Kikuta;T. Koike;Wanchun Jin;Masanori Imai;H. Kurosaki]
通讯作者:
Yoshimi Ichimaru;Koichi Kato;Rina Nakatani;K. Sugiura;H. Mizutani;Emiko Kinoshita-Kikuta;T. Koike;Wanchun Jin;Masanori Imai;H. Kurosaki
Crystal Structure of Bis{1,3-bis[bis(pyridin-2-ylmethyl)amino]propan-2-olato-dizinc(II)}orthophosphate Tris(perchlorate) Octahydrate, [(Phos-tag)<sub>2</sub>-PO<sub>4</sub><sup>3−</sup>][ClO<sub>4</sub><sup>−</sup>]<sub>3</sub>·8H<sub>2</sub>O
双{1,3-双[双(吡啶-2-基甲基)氨基]丙-2-olato-二锌(II)}正磷酸三(高氯酸盐)八水合物的晶体结构,[(Phos-tag)<sub>2 </sub>-PO<sub>4</sub><sup>3−</sup>][ClO<sub>4</sub><sup>−</sup>]<sub>3</sub >·8H<sub>2</sub>O
DOI:
10.2116/xraystruct.37.87
发表时间:
2021
期刊:
X-ray Structure Analysis Online
影响因子:
0.2
作者:
[Ichimaru Yoshimi, Kato Koichi, Jin Wanchun, Sugiura Kirara, Kinoshita-Kikuta Emiko, KINOSHITA Eiji, Kurosaki Hiromasa, Koike Tohru]
通讯作者:
Koike Tohru
DOI:
10.2198/jelectroph.66.13
发表时间:
2022
期刊:
Journal of Electrophoresis
影响因子:
--
作者:
[Kinoshita-Kikuta, E., Ino, Y., Kimura, Y., Akiyama, T., Kinoshita, E., Koike, T.]
通讯作者:
T.
新規ヒスチジンキナーゼ阻害剤スクリーニングのためのイムノドットブロットアッセイ
用于筛选新型组氨酸激酶抑制剂的免疫点印迹测定
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[丸田志乃, 木下恵美子, 木下英司, 小池透]
通讯作者:
小池透
無細胞タンパク質合成系で作成したSrcファミリーチロシンキナーゼのリン酸化状態と活性
使用无细胞蛋白质合成系统创建的 Src 家族酪氨酸激酶的磷酸化状态和活性
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[木下恵美子, 木下英司, 小池透]
通讯作者:
小池透
共 7 条
病原菌のリン酸化酵素阻害剤(抗生物質)の多検体高速スクリーニングシステムの開発
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批准号:24K09710
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:木下 恵美子
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依托单位:
オーダーメード医療を目的とした迅速かつ網羅的な疾患遺伝子多型検出法の開発
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批准号:18790120
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:木下 恵美子
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依托单位:
海外基金