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新規抗生物質の標的分子探索を目指した病原菌の情報伝達経路プロテオームデータの創出

创建病原菌信息转导途径的蛋白质组数据，旨在寻找新抗生素的靶分子

基本信息

批准号：
21K06455
负责人：
木下恵美子
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

近年，病原菌の環境適応，薬剤耐性などに関わる情報伝達経路(2成分伝達経路）を構成するヒスチジンキナーゼ(HK)の阻害剤の開発が国内外で進められている。その経路に含まれる一連のタンパク質，例えば，HK とペアをなすもう一つの成分であるレスポンスレギュレータ(RR)も新規抗生物質の標的となりうるが，HK とRRは化学的に不安定なヒスチジンやアスパラギン酸のリン酸化を介して情報伝達経路を行うため，質量分析による解析が適用できず，経路全体を俯瞰するプロテオームデータがない。本研究では「フォスタグ」を用いた不安定リン酸化タンパク質の解析技術を利用し，細菌のシグナル活性化と外部環境因子との関連を網羅的に解析する。そうして蓄積したデータから分子間相互作用や情報伝達機構のクロストークなどが明らかになり，阻害剤などの新規抗生物質の標的分子が浮かび上がるようになることを目的とする。昨年度は，腸管出血性大腸菌など強い病原性の株が知られる，大腸菌の２成分情報伝達経路を再現した擬似的な大腸菌を作成することを目標とした。大腸菌には，遺伝子がタンデムに並び機能的なペアと考えられる HK とRRが 29 組あるので，それら計 58 遺伝子をクローニングした。検討のため，１ペアについて HKと RR を互いに異なる複製開始点を持つ２種類の発現プラスミドにそれぞれサブクローニングした。８種類の発現プラスミドを用いて，良好に発現する組み合わせを検討したところ，３組の組み合わせで，HK とRRの共発現が可能であった。今年度は，他のHK とRRについても同様に発現プラスミドにサブクローニングを行った。良好に発現する遺伝子と発現できない遺伝子があり，できるだけ多くの遺伝子が発現できるよう検討を続けている。また，病原性発現に関わるHKの発現に伴うトランスクリトーム変化を調べるRNAseqを計画している。

In recent years, the environmental adaptation of pathogenic bacteria, drug resistance, related information transmission pathway (2-component transmission pathway) has been formed, and the development of protective agents for pathogens (HK) has been progressing at home and abroad. For example, HK and RR contain a series of chemical components, such as HK and RR, and the target of new antibiotic substances. HK RR chemical instability, acid and acidification, and information transmission. Quality analysis is applicable to all chemical components. In this study, we analyzed the relationship between bacterial activation and external environmental factors by using the analysis technology of unstable factors. The target molecule of the new antibiotic substance is floating on the surface of the molecule. Last year, the intestinal hemorrhagic Escherichia coli (IHEC) was identified as a virulent strain, and the information on the two components of Escherichia coli was re-established. E. coli, the virus is isolated and functional, and there are 29 groups of virus isolated. 1. Copy start point, 2. Copy start point, 2. 8 types of discovery are available, good discovery is possible, 3 types of discovery are possible, HK and RR are possible. This year, he and his company will continue to work together. Good development of the gene and development of the gene. In addition, pathogenic development is related to the development of HK, which is accompanied by the development of RNAseq.

项目成果

期刊论文数量（16）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Characterization of Zinc(II) Complex of 1,4,7,10-Tetrazacyclododecane and Deprotonated 5-Fluorouracil (FU) in Crystalline/Solution States and Evaluation of Anticancer Activity: Approach for Improving the Anticancer Activity of FU

DOI：
10.1016/j.inoche.2022.110221
发表时间：
2022-11
期刊：
Inorganic Chemistry Communications
影响因子：
3.8
作者：
Yoshimi Ichimaru;Koichi Kato;Rina Nakatani;K. Sugiura;H. Mizutani;Emiko Kinoshita-Kikuta;T. Koike;Wanchun Jin;Masanori Imai;H. Kurosaki
通讯作者：
Yoshimi Ichimaru;Koichi Kato;Rina Nakatani;K. Sugiura;H. Mizutani;Emiko Kinoshita-Kikuta;T. Koike;Wanchun Jin;Masanori Imai;H. Kurosaki

Crystal Structure of Bis{1,3-bis[bis(pyridin-2-ylmethyl)amino]propan-2-olato-dizinc(II)}orthophosphate Tris(perchlorate) Octahydrate, [(Phos-tag)2-PO43−][ClO4−]3·8H2O

双{1,3-双[双(吡啶-2-基甲基)氨基]丙-2-olato-二锌(II)}正磷酸三(高氯酸盐)八水合物的晶体结构，[(Phos-tag)2 -PO43−][ClO4−]3·8H2O

DOI：
10.2116/xraystruct.37.87
发表时间：
2021
期刊：
X-ray Structure Analysis Online
影响因子：
0.2
作者：
Ichimaru Yoshimi;Kato Koichi;Jin Wanchun;Sugiura Kirara;Kinoshita-Kikuta Emiko;KINOSHITA Eiji;Kurosaki Hiromasa;Koike Tohru
通讯作者：
Koike Tohru

Use of Escherichia coli expression system for analyzing kinase motifs

使用大肠杆菌表达系统分析激酶基序