Establishment of various and comparable liver injury models with low molecular weight compounds

用低分子化合物建立各种可比较的肝损伤模型

• 批准号: 21K06663
• 负责人: 水野 忠快
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06663/
• 关键词: 肝機能障害; トランスクリプトーム; 免疫細胞; deconvolution; 化合物; 化学物質; 毒性; プロファイル; プロファイルデータ解析; 低分子化合物; RNA-seq

肝機能障害の進行機序を①危険因子への曝露, ②免疫応答の亢進, そして③病態進行の連結として捉えると, 3層からなるネットワークとして考えることができる。各層の役者はよく理解されている一方, 入力と出力の対応関係は整理されておらず, そもそも比較可能な知見が存在しない。多様かつ比較可能な知見を集めることで入力から出力までの経路の共通点や相違点が明らかとなる。本研究では, 低分子化合物を用いて比較可能な肝機能障害モデル群を樹立することを目的とする。2021年度には, 本研究目的のために2種類のデータを取得した。2022年度はこれらのデータを解析した。一つ目はマウスのデータであり, 文献調査に基づいて選出された化合物群を処理した際のトランスクリプトームデータと, 対応する肝臓中の免疫細胞データ, 及び生化学検査値である。本データの解析により, 比較的少数ではあるものの, 化合物により様々なスペクトルの肝機能障害を惹起した際の免疫細胞の挙動をデータ駆動型に評価可能となる。解析の結果, まず全体的な傾向としてALT上昇時に好中球が増大することを確認した。興味深いことにこのとき単球が続くものとそうでないものに分かれることを見出した。二つ目はラット免疫細胞のトランスクリプトームデータである。同データを用いることでバルクのトランスクリプトームデータを入力に試料内の免疫細胞比率を推定するデータ解析手法Deconvolution法が可能となる。取得したデータにより確立したラットのDeconvolution法を用いてラットの大規模毒性データベースであるOpen TG-GATEs収載のトランスクリプトームデータを解析し, 得られた免疫細胞のデータを用いてクラスタリングを実施した。結果, 同データベースの化合物が誘導する免疫細胞の挙動は, 4クラスターに分かれることを見出した。

The progression of liver dysfunction includes: ① exposure of risk factors; ② hyperactivity of immune response; ③ pathological progression of links; 3 layers of development; Each layer of workers understand the relationship between the input force and the output force, and the relationship between the input force and the output force is relatively unknown. Multiple comparisons are possible. See the common point of the input force and the output force. See the common point of the input force and the output force. The purpose of this study is to establish a mechanism for the development of liver dysfunction by comparing the use of low molecular weight compounds. In 2021, the purpose of this study was to obtain 2 kinds of information. 2022 - 2023 Annual Report of the United Nations Office at Geneva. A review of the literature was conducted to select compounds for treatment, to identify immune cells in the liver, and to evaluate biochemical studies. The analysis of this compound, compared with a few other compounds, may cause liver dysfunction and immune cell activation. The analysis results show that the overall tendency of ALT to increase is positive. The taste is deep, the taste is deep. 2. The immune cells are not immune. It is possible to estimate the ratio of immune cells in the sample by the method of Deconvolution. The Deconvolution method for obtaining and establishing the mass toxicity profile was used to analyze the profile of Open TG-GATEs and to obtain the immune cell profile. As a result, the same compounds can induce immune cell movement, and 4 kinds of immune cells can be detected.