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ラット腹膜中皮腫検体でのマイクロサテライトマーカーを用いるゲノム欠失解析

使用微卫星标记对大鼠腹膜间皮瘤标本进行基因组缺失分析

基本信息

批准号：
21K06968
负责人：
岡崎泰昌
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06968/
关键词：
中皮腫ラット動物モデルマイクロサテライト

项目摘要

ヒト悪性中皮腫で高頻度に見られる遺伝子異常は、CDKN2A/2B(Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A/2B)の欠失、NF2(neurofibromatosis type 2, merlin)の欠失や遺伝子変異、BAP1(BRCA1-associated protein) 遺伝子変異が知られている。報告者が所属する研究室で行ったaCGH(array-based comparative genomic hybridization)によるラット悪性腹膜中皮腫でもCdkn2a/2bはゲノム欠失が高頻度に起き、Nf2もゲノム欠失が見られた。一方、Bap1の欠失は明らかに少なかった。ヒト悪性中皮腫ではBap1は遺伝子変異や小領域の欠失による機能喪失がしばしばみられ、良質な抗体が市販されていることもあり、FISH(fluorescent insitu hybridization)より免疫染色による蛋白分子の解析が施行されている。一方、CDKN2A/2B領域の欠失の有無は、免疫染色よりもFISHが推奨されている。そのため、Cdkn2a/2b領域が存在する5番染色体や、Nf2領域が存在する14番染色体を中心にPCR法によるF1 hybrid rat [Brown-Norway, Fischer344 (F344)] 由来悪性腹膜中皮腫のマイクロサテライト解析を行った。クロシドライト、クリソタイル、トレモライトといったアスベスト線維や多層カーボンナノチューブにより異なるゲノム欠失パターンが見られたが、中皮腫を自然発症しやすいF344由来母ゲノム欠失への偏りは明瞭ではなく、検体を追加する予定である。また、鉄化合物など中皮腫発がんを来す物質による中皮腫検体も追加検討する予定である。

The high frequency of MSP was observed in the abnormal expression of CDKN2A/2B(Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A/2B), NF2 (neurofibrosis type 2, merlin) and BAP1 (BRCA1-associated protein). The reporter's lab conducted aCGH(array-based comparative genomic hybridization), which is a high-frequency event, and Nf2, which is a high-frequency event. One side, Bap1 is missing. In the case of BAP1, the protein molecules were analyzed by FISH(fluorescent insitu hybridization) and immunostaining. One side, CDKN2A/2B domain missing, immunostaining, FISH and other putative. The F1 hybrid rat [Brown-Norway, Fischer344 (F344)] was analyzed by PCR from the center of chromosome 5 and chromosome 14 in Cdkn2a/2b domain. F344 is a natural symptom of skin swelling due to the absence of a line or multilayer structure. For iron compounds, please refer to the following table.