权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

機能性sRNAとmRNA結合タンパク質CsrAによる統合型発現制御システムの解明

功能性 sRNA 和 mRNA 结合蛋白 CsrA 阐明整合表达控制系统

基本信息

批准号：
21K07004
负责人：
美間健彦
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Ehime Prefectural University of Health Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Vibrio alginolyticusの4つsRNA（sRNA1、sRNA2、sRNA3、sRNA4）の発現を調節するタンパク質を探索した結果、sRNA1のプロモーター領域に結合するタンパク質として、Leucine-responsive regulator (Lrp)が見出された。lrp欠失株では、sRNA1の発現量が2.3倍に増加し、lrp相補株では、sRNA1の発現量が約1/3に減少した。以上より、LrpがsRNA1の発現を調節することが明らかとなった。Lrpを精製してsRNA1のプロモーター領域の結合を調べた結果、LrpがsRNA1のプロモーター領域に結合することが明らかとなった。lrpの上流領域には、大腸菌のLrp結合部位のコンセンサス配列に類似性を示す領域が３ヶ所存在した。以上より、LrpはsRNA1のプロモーター領域に結合して、その発現を調節すると示唆された。ロイシンを添加した培地で野生株を培養したところ、sRNA1の発現量が２倍に増加した。一方、lrp欠失株ではsRNA1の発現量に差は見られなかった。さらに、LrpのsRNA1プロモーター領域への結合がロイシンによって阻害された。以上より、Lrpは、ロイシン非存在下ではプロモーター領域に結合してｓRNA1の発現を抑制しており、ロイシンが結合するとsRNA1のプロモーターから外れｓRNA1の発現が脱抑制されると考えられる。我々はこれまでにsRNA1の発現が、VarS/VarA二成分制御系およびArcB/ArcA二成分制御系によって調節されることを明らかにした。本研究によりsRNA1の発現がLrpによっても調節されることが明らかとなった。以上より、本菌の４つのsRNAは、複数の環境シグナルを演算して遺伝子発現を調節し、環境に適応するための統合演算システムと考えられる。

The regulation of the expression of 4 sRNAs (sRNA1, sRNA2, sRNA3, sRNA4) in Vibrio alginolyticus was investigated. The binding of sRNA1 to the regulatory domain was investigated. Leucine-responsive regulator (Lrp) was also found. The expression of sRNA1 in lrp deficient plants increased by 2.3 times, while that in lrp complementary plants decreased by about 1/3. The expression of sRNA1 is regulated by the above factors. Lrp is purified and the binding of sRNA1 to the domain is regulated. Lrp binding sites of E. coli are similar to those in the upstream domain. The above, Lrp sRNA1 in the field of binding, expression and regulation The expression of sRNA1 in wild plants increased by 2 times when the virus was added to the culture medium. The expression of sRNA1 was significantly higher than that of the control group (P <0.01). In addition, Lrp's sRNA1 may be used to prevent the formation of a complex domain. In the absence of the above Lrp, the expression of sRNA1 is inhibited by binding to the domain, and the expression of sRNA1 is inhibited by binding to the domain. The expression of sRNA1, VarS/VarA two-component control system and ArcB/ArcA two-component control system were investigated. In this study, the expression of sRNA1 was regulated by Lrp. The above results show that the sRNA of the four strains of this bacterium is related to the regulation of gene expression and environmental adaptation.