腫瘍Microbiome-Viromeから探る難治性悪性リンパ腫バイオマーカー

从肿瘤微生物组-病毒组中探索难治性恶性淋巴瘤的生物标志物

• 批准号: 21K07231
• 负责人: 大保木 啓介
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07231/
• 关键词: 悪性リンパ腫; バイオマーカー; virome; がん; 腫瘍細菌; 腫瘍ウイルス

本研究はリンパ腫の中で最も頻度の高い、びまん性大細胞型B細胞性リンパ腫（DLBCL）等を対象とする研究を計画している。DLBCLは遺伝子異常の面から異質性の高い（不均一な）疾患であり、“Cell-of-Origin”や“Double hit lymphoma”などの分類法はあるものの、これまでのところ、難治性のDLBCLを感度・特異度良く予測できるバイオマーカーや遺伝子プロファイルは明らかにされていない。本研究では、病院で収集保存された患者試料のDNAやRNAから微生物プロファイルを探索・同定し、体細胞変異（遺伝子異常）、内在性mRNA等の遺伝子発現情報との組み合わせによって、診断に有用な難治性DLBCLの予後予測法を開発することを目的とする。本年度は研究分担者の協力のもと、DLBCL患者リンパ節試料からDNAおよびRNAを抽出し、次世代シークエンス技術による遺伝子異常検出のためのターゲットシークエンスを実施した。採用したターゲットシークエンスはPCRアンプリコンを多数作成して行う方式であり、おおよそ自動化されたシステムによって一塩基変異や挿入・欠失変異を検出することができた。一方で、DLBCLの分類に重要な要素である体細胞性のコピー数変化の検出は、このターゲットシークエンス方式においてはコンセンサスのある基準が確立されていない。そのため、追加で対照（非腫瘍性）DNAのターゲットシークエンスデータの取得を行ったほか、解析ツールの選定、その解析環境構築とテスト、閾値の設定についての文献調査を実施し、検体組織の腫瘍含有率を考慮した合理性のある判定基準を作成した。

In this study は リ ン パ swollen の で も most high frequency の い, び ま ん sexual large cell type B cells リ ン パ swollen (DLBCL) を like と seaborne す を る research project し て い る. DLBCL 伝 subabnormal <s:1> surface ら ら heterogeneity <e:1> high <s:1> (heterogeneous な) disease であ, "Cell-of-Origin" や "Double hit Lymphoma "な ど の taxonomy は あ る も の の, こ れ ま で の と こ ろ, difficultly の DLBCL を good sense, specific degrees く be で き る バ イ オ マ ー カ ー や posthumous son 伝 プ ロ フ ァ イ ル は Ming ら か に さ れ て い な い. This study で は, hospital で 収 set save さ れ た patient sample の DNA や RNA か ら microbial プ ロ フ ァ イ ル を exploration with fixed し, somatic - different (but 伝 son exception), inner mRNA の heritage 伝 発 now son intelligence と の group み close わ せ に よ っ て, diagnostic に useful な refractory DLBCL の to be law を open after 発 す る こ と を purpose と す Youdaoplaceholder0. This annual は study sharers の together の も と, patients with DLBCL リ ン パ section sample か ら DNA お よ び RNA を drew し, next generation シ ー ク エ ン ス technology に よ る heritage 伝 child abnormal 検 の た め の タ ー ゲ ッ ト シ ー ク エ ン ス を be applied し た. Using し た タ ー ゲ ッ ト シ ー ク エ ン ス は PCR ア ン プ リ コ ン を most consummate し て line う way で あ り, お お よ そ automation さ れ た シ ス テ ム に よ っ て a salt base - different や, scions into owe - vision loss, を 検 out す る こ と が で き た. で, DLBCL に の classification is key factor な で あ る somatic sex の コ ピ ー number variations change の 検 は, こ の タ ー ゲ ッ ト シ ー ク エ ン ス way に お い て は コ ン セ ン サ ス の あ る benchmark が establish さ れ て い な い. そ の た め, additional で polices according to (not swollen sores) DNA の タ ー ゲ ッ ト シ ー ク エ ン ス デ ー タ の を row っ た ほ か, parse ツ ー ル の selected, そ の analytical environment construct と テ ス ト, threshold set numerical の に つ い て の literature survey を be し, 検 body tissue の swollen sores containing rate を consider し た rationality の あ る determine benchmark を made し た.

项目成果

Mutation Analysis of Very Late Relapse of Myeloid Malignancies after Stem Cell Transplantation.

干细胞移植后骨髓恶性肿瘤极晚期复发的突变分析。

• 发表时间: 2021
• 作者: Takashi Toya;Daichi Sadato;Yasuhiro Kanbara;Chizuko Hirama;Kyoko Haraguchi;Hiroaki Shimizu;Yuho Najima;Takeshi Kobayashi;Yoshiki Okuyama;Keisuke Oboki;Hironori Harada;Kazuteru Ohashi;Yuka Harada;Noriko Doki
• 通讯作者: Noriko Doki

Characteristics of clonal hematopoiesis in long-term survivors after allogeneic SCT

异基因SCT后长期存活者的克隆造血特点

• 发表时间: 2021
• 作者: 庄司良平;田澤大;梶原義典;李云成;山田元彦;井上弘章;永井康雄;菊地覚次;黒田新士; 吉田龍一;浦田泰生;香川俊輔;藤原俊義;Takashi Toya ，Daichi Sadato，Chizuko Hirama，Kyoko Haraguchi， Yasuhiro Kanbara，Yuya Atsuta，Ken Suzaki，Ryosuke Konuma， Hiroto Adachi，Atsushi Wada，Yuya Kishida，Yusuke Uchibori， Junichi Mukae，N Shingai，H Shimizu，Y Najima， T Kobayashi，Y Okuyama，K Oboki， H Harad
• 通讯作者: Takashi Toya ，Daichi Sadato，Chizuko Hirama，Kyoko Haraguchi， Yasuhiro Kanbara，Yuya Atsuta，Ken Suzaki，Ryosuke Konuma， Hiroto Adachi，Atsushi Wada，Yuya Kishida，Yusuke Uchibori， Junichi Mukae，N Shingai，H Shimizu，Y Najima， T Kobayashi，Y Okuyama，K Oboki， H Harad

移植後超晩期再発骨髄系腫瘍の遺伝子変異動態

移植后极晚复发的骨髓肿瘤的基因突变动态

• 发表时间: 2021
• 作者: 遠矢 嵩;貞任 大地;平間 千津子;大保木 啓介;原田 浩徳;原田 結花
• 通讯作者: 原田 結花

急性骨髄性白血病に対する同種移植周術期のベネトクラクス併用救援療法の検討

急性髓系白血病同种异体移植围手术期联合维奈托克挽救治疗的探讨

• 发表时间: 2022
• 作者: 加藤千賀;名島悠峰;貞任大地;平間千津子;酒井知史;神原康弘;小沼 亮介;熱田雄也;和田敦司;村上大介;中島詩織;内堀雄介;尾内大志;西島暁彦;迎純一;新谷直樹;遠矢嵩;清水啓明;小林武;大保木啓介;原田浩徳;坂巻壽;大橋一輝;原田結花;土岐典子
• 通讯作者: 土岐典子

Bone marrow smears are eligible materials for targeted sequencing for diagnosing myeloid neoplasms

骨髓涂片是诊断骨髓肿瘤的靶向测序的合格材料

• 发表时间: 2021
• 作者: Kohashi Koki;Mori Yusuke;Narumi Rika;Kozawa Kei;Kamasaki Tomoko;Ishikawa Susumu;Kajita Mihoko;Kobayashi Rei;Tamori Yoichiro;Fujita Yasuyuki;Daichi Sadato，Chizuko Hirama，Ai Soma，Ayaka Yamaguchi， Hiroko Kogure，Mina Ogawa，Noriko Doki，Kazuteru Ohashi， Hironori Harada，Keisuke Oboki，Yuka Harada
• 通讯作者: Daichi Sadato，Chizuko Hirama，Ai Soma，Ayaka Yamaguchi， Hiroko Kogure，Mina Ogawa，Noriko Doki，Kazuteru Ohashi， Hironori Harada，Keisuke Oboki，Yuka Harada