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フェノムワイド関連解析及び日本人特異的変異による過眠症の分子基盤の解明

日本特有突变导致的嗜睡的分子基础的全表组关联分析和阐明

基本信息

批准号：
21K07534
负责人：
児玉亨
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

特発性過眠症のエクソーム解析及びゲノムワイド関連解析を実施し、特発性過眠症の関連変異としてオレキシン前駆体遺伝子のクリベージサイトに位置するアミノ酸置換を伴う変異（p.Lys68Arg）を同定した。患者群におけるオレキシン前駆体遺伝子の本変異のマイナーアリル頻度（MAF）は1.67%であるのに対し、健常者群での本変異のMAFは0.32%であり、オッズ比5.36、P値2.7×10-8と有意な関連を示した。この変異の機能的な影響を検討するため、変異体と野生型のオレキシン前駆体ペプチドを用いて、切断酵素のPC1/3及びPC2による切断活性を評価した。その結果、変異体はほとんど切断されないことを確認した。切断されなかったオレキシン前駆体の受容体結合活性をin vitroで検討した結果、薬理学的活性が低いことも確かめた。そこで、東北メディカルメガバンク機構より分譲を受けた変異情報（3.5KJPNv2及びSNPアレイ）及び調査票（生活）情報の睡眠情報等を用いた解析により、本変異の特発性過眠症リスクアリルを有する健常者の睡眠表現型に、特徴が存在するか調査した。具体的には全ゲノムリファレンスパネル（シークエンス）の3.5KJPNv2より得られた遺伝子型情報（対象症例数：1,519例）及びSNPアレイより得られた遺伝子型情報（対象症例数：14,348例）を用いて、本変異（p.Lys68Arg）と調査票（生活）情報の睡眠情報等に関連性が認められるか統計解析を実施した。結果として3.5KJPNv2及びSNPアレイの両方のセットにおいて、本変異と有意な相関を示す睡眠表現型は確認されなかった。

The analysis of early onset sleep disorders and the analysis of early onset sleep disorders were carried out. The association of early onset sleep disorders with early onset sleep disorders was determined by the position of early onset sleep disorders associated with acid substitution (p.Lys68Arg). The frequency of spontaneous variation (MAF) in patients was 1.67%, while in healthy subjects it was 0.32%, P = 2.7×10-8 and P = 5.36. The effects of these different functions were investigated in the wild type and in the absence of PC1/3 and PC2. The result of the test was confirmed. The receptor binding activity of the cleaved The sleep phenotype of healthy people with idiopathic hypersomnia and the presence of characteristics were investigated by analyzing sleep information such as sleep information (3.5KJPNv2 and SNP) and questionnaire (life) information. Specifically, statistical analysis was performed on the correlation between the 3.5KJPNv2 gene type information (number of target cases: 1,519 cases) and SNP gene type information (number of target cases: 14,348 cases) obtained from the complete set of gene types, the p.Lys68Arg gene type information, the poll (life) information, and sleep information. The results showed that 3.5KJPNv2 and SNP were significantly correlated with sleep phenotype.

项目成果

期刊论文数量（9）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

公益財団法人東京都医学総合研究所　睡眠プロジェクト

东京都医学科学研究所睡眠项目

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Genome-wide association study of idiopathic hypersomnia in a Japanese population

日本人群特发性嗜睡症的全基因组关联研究

DOI：
10.1007/s41105-021-00349-2
发表时间：
2021
期刊：
Sleep and Biological Rhythms
影响因子：
1.1
作者：
Tanida Kotomi;Shimada Mihoko;Khor Seik-Soon;Toyoda Hiromi;Kato Kayoko;Kotorii Nozomu;Kotorii Tatayu;Ariyoshi Yu;Kato Takao;Hiejima Hiroshi;Ozone Motohiro;Uchimura Naohisa;他15名;Kodama Tohru;Inoue Yuichi;Mishima Kazuo;Honda Makoto;Tokunaga Katsushi;Miyagawa
通讯作者：
Miyagawa

公益財団法人東京都医学総合研究所精神行動医学研究分野睡眠プロジェクト

东京都医学科学研究所精神行为医学系睡眠项目