フェノムワイド関連解析及び日本人特異的変異による過眠症の分子基盤の解明

日本特有突变导致的嗜睡的分子基础的全表组关联分析和阐明

• 批准号: 21K07534
• 负责人: 児玉 亨
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07534/
• 关键词: 睡眠; 眠気; 特発性過眠症; オレキシン; ナルコレプシー; バイオバンク; 関連解析; 遺伝要因; 過眠症; フェノムワイド関連解析; ゲノム; 変異

特発性過眠症のエクソーム解析及びゲノムワイド関連解析を実施し、特発性過眠症の関連変異としてオレキシン前駆体遺伝子のクリベージサイトに位置するアミノ酸置換を伴う変異（p.Lys68Arg）を同定した。患者群におけるオレキシン前駆体遺伝子の本変異のマイナーアリル頻度（MAF）は1.67%であるのに対し、健常者群での本変異のMAFは0.32%であり、オッズ比5.36、P値2.7×10-8と有意な関連を示した。この変異の機能的な影響を検討するため、変異体と野生型のオレキシン前駆体ペプチドを用いて、切断酵素のPC1/3及びPC2による切断活性を評価した。その結果、変異体はほとんど切断されないことを確認した。切断されなかったオレキシン前駆体の受容体結合活性をin vitroで検討した結果、薬理学的活性が低いことも確かめた。そこで、東北メディカルメガバンク機構より分譲を受けた変異情報（3.5KJPNv2及びSNPアレイ）及び調査票（生活）情報の睡眠情報等を用いた解析により、本変異の特発性過眠症リスクアリルを有する健常者の睡眠表現型に、特徴が存在するか調査した。具体的には全ゲノムリファレンスパネル（シークエンス）の3.5KJPNv2より得られた遺伝子型情報（対象症例数：1,519例）及びSNPアレイより得られた遺伝子型情報（対象症例数：14,348例）を用いて、本変異（p.Lys68Arg）と調査票（生活）情報の睡眠情報等に関連性が認められるか統計解析を実施した。結果として3.5KJPNv2及びSNPアレイの両方のセットにおいて、本変異と有意な相関を示す睡眠表現型は確認されなかった。

Special 発 sex had sleep disorder の エ ク ソ ー ム parsing and び ゲ ノ ム ワ イ ド masato analytical を even be し shi, 発 sex had sleep disorder の masato even - different と し て オ レ キ シ ン 駆 body before heritage 伝 son の ク リ ベ ー ジ サ イ ト に position す る ア ミ ノ acid replacement を with う - vision (p.L ys68Arg) with fixed し を た. Group of patients with に お け る オ レ キ シ ン 駆 body before heritage 伝 の son Ben - different の マ イ ナ ー ア リ ル frequency (MAF) は 1.67% で あ る の に し, health often group of seaborne で の this - different の MAF は 0.32% で あ り, オ ッ ズ than 5.36, P nt 2.7 x 10-8 と intentionally な masato even を shown し た. こ の - different な の functionary influence を beg す 検 る た め, - variant と wild-type の オ レ キ シ ン 駆 body before ペ プ チ ド を with い て, cut off the enzymes の PC1/3 and び PC2 に よ る cut active を review 価 し た. Youdaoplaceholder0 result, variant ほとん ほとん されな cut off されな とを とを confirm た た. Cut off さ れ な か っ た オ レ キ シ ン 駆 body の is let body before binding activity を in vitro で beg し 検 た results, low physical activity が 薬 い こ と も か indeed め た. そ こ で, northeast メ デ ィ カ ル メ ガ バ ン ク institutions よ り points 譲 を by け た - different intelligence (3.5 KJPNv2 and び SNP ア レ イ) and び survey ticket (life) intelligence の sleep and intelligence を with い た parsing に よ り, this - different の 発 sex had sleep disorder リ ス ク ア リ ル を have す る health often is の sleep phenotypes に, 徴 が exist す る か survey し た. Specific に は full ゲ ノ ム リ フ ァ レ ン ス パ ネ ル (シ ー ク エ ン ス) 3.5 KJPNv2 の よ り have ら れ た heritage 伝 type child intelligence (like disease cases seaborne: 1519 cases) and び SNP ア レ イ よ り must ら れ た heritage 伝 type child intelligence (polices as disease cases: (14,348 cases) を use を て, original variation (p.Lys68Arg) と survey vote (life) information to sleep information, etc. に correlation が recognize められる statistical analysis を actually apply た. Results と し て 3.5 KJPNv2 and び SNP ア レ イ の struck party の セ ッ ト に お い て phase, this - different と intentionally な masato を す sleep phenotypes in は confirm さ れ な か っ た.

项目成果

公益財団法人東京都医学総合研究所 睡眠プロジェクト

东京都医学科学研究所睡眠项目

Genome-wide association study of idiopathic hypersomnia in a Japanese population

日本人群特发性嗜睡症的全基因组关联研究

• DOI: 10.1007/s41105-021-00349-2
• 发表时间: 2021
• 期刊: Sleep and Biological Rhythms
• 影响因子: 1.1
• 作者: Tanida Kotomi;Shimada Mihoko;Khor Seik-Soon;Toyoda Hiromi;Kato Kayoko;Kotorii Nozomu;Kotorii Tatayu;Ariyoshi Yu;Kato Takao;Hiejima Hiroshi;Ozone Motohiro;Uchimura Naohisa;他15名;Kodama Tohru;Inoue Yuichi;Mishima Kazuo;Honda Makoto;Tokunaga Katsushi;Miyagawa
• 通讯作者: Miyagawa

公益財団法人東京都医学総合研究所 精神行動医学研究分野 睡眠プロジェクト

东京都医学科学研究所精神行为医学系睡眠项目

A variant in orexin receptor-2 is associated with self-reported daytime sleepiness in the Japanese population

• DOI: 10.1038/s10038-022-01015-2
• 发表时间: 2022-01-17
• 期刊: JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Miyagawa, Taku;Shimada, Mihoko;Honda, Makoto
• 通讯作者: Honda, Makoto

オレキシン前駆体遺伝子の稀な変異と特発性過眠症との関連

食欲素前体基因的罕见突变与特发性睡眠过度之间的关联

• 发表时间: 2022
• 作者: 小原知之;二宮利治;M Kimura;宮川 卓 他
• 通讯作者: 宮川 卓 他