ChIP-Seqを用いた若年性骨髄単球性白血病の網羅的ヒストン修飾解析

使用 ChIP-Seq 对幼年型粒单核细胞白血病进行全面的组蛋白修饰分析

• 批准号: 21K07771
• 负责人: 村松 秀城
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07771/
• 关键词: JMML; 若年性骨髄単球性白血病; クロマチン免疫沈降シーケンス; ヒストン修飾

若年性骨髄単球性白血病（juvenile myelomonocytic leukemia; JMML）は、主に5歳未満の小児に発症する予後不良な造血器腫瘍である。唯一の根治療法は同種造血細胞移植であるが、一部の症例は無治療で長期生存することも知られており、予後を正確に予測するバイオマーカーに基づく最適医療（Precision Medicine）の実現が求められている。我々は、これまでの研究で網羅的遺伝子解析の技術を用いて遺伝子変異/遺伝子発現/遺伝子メチル化の各プロファイリングを行い、多くのJMMLの予後予測因子を明らかにした。本研究では、クロマチン免疫沈降シーケンス（ChIP-Seq）を用いてヒストン修飾の網羅的プロファイリングを行い、JMMLの疾患特異的なエンハンサー領域の同定およびこれまでに得られている網羅的ゲノム情報との統合解析を通じて、分子学的発症メカニズムの全体像を明らかにすることを目標としている。これまでに、24例のJMML臨床検体を用いてChIP-Seq解析を完了し、JMML特異的にH3K27acのヒストンマークが濃縮しているエンハンサー領域の候補を抽出した。さらに、2021年度にはSingle-cell RNA-seqの解析手法を確立し、少数例ではあるがJMML臨床検体での解析を実施した。2022年度には、さらにsingle-cell RNA-seqの解析検体を増やし、現在、すでに完了している他のゲノム解析結果（DNAシーケンス、RNAシーケンス、遺伝子メチル化解析）との統合解析を遂行中である。

If juvenile myelomonocytic leukemia (JMML) develops in children aged 5 years, it may cause poor hematopoiesis. The only radical therapy is allogeneic hematopoietic cell transplantation. Some cases have no treatment. Long-term survival. Knowledge and prediction. Precision Medicine. Our research has made use of the genetic analysis technology we have gathered to implement various types of genetic variation/genetic discovery/genetic integration, and many JMML predictive factors have been made clear. In this study, we investigated the use of ChIP-Seq to modify the network of proteins, the identification of JMML disease-specific protein domains, and the identification of molecular markers. In 24 cases, ChIP-Seq analysis of JMML clinical samples was completed, and candidates for JMML specific H3K27ac samples were extracted. In 2021, the analysis method of Single-cell RNA-seq was established, and in a few cases, the analysis of JMML clinical models was implemented. In 2022, the analysis model of single-cell RNA-seq has been increased, and now, it has been completed. The integrated analysis results (DNA analysis, RNA analysis, genetic analysis) are still in progress.

项目成果

Azacitidine as a bridge to transplantation in juvenile myelomonocytic leukemia

阿扎胞苷作为幼年粒单核细胞白血病移植的桥梁

• DOI: 10.1111/ped.14929
• 发表时间: 2022
• 期刊: Pediatrics International
• 影响因子: 1.4
• 作者: Takebayashi Akira;Yamamoto Masaki;Igarashi Keita;Muramatsu Hideki;Kawasaki Yukihiko
• 通讯作者: Kawasaki Yukihiko

A retrospective analysis of azacitidine treatment for juvenile myelomonocytic leukemia

阿扎胞苷治疗幼年粒单核细胞白血病的回顾性分析

• DOI: 10.1007/s12185-021-03248-x
• 发表时间: 2021
• 期刊: International Journal of Hematology
• 影响因子: 2.1
• 作者: Honda Yuko;Muramatsu Hideki;Nanjo Yuka;Hirabayashi Shinsuke;Meguro Toru;Yoshida Nao;Kakuda Harumi;Ozono Shuichi;Wakamatsu Manabu;Moritake Hiroshi;Yasui Masahiro;Sano Hideki;Manabe Atsushi;Sakashita Kazuo
• 通讯作者: Sakashita Kazuo

JMMLにおける大規模遺伝子解析に基づいた予後予測.

基于 JMML 中大规模遗传分析的预后预测。

• 发表时间: 2022
• 作者: 石田七彩、植田優生、松林潤、金橋徹;今井宏彦;山田重人、高桑徹也;村松秀城.
• 通讯作者: 村松秀城.

Human leukocyte antigen 7/8-matched unrelated bone marrow transplantation using anti-thymocyte globulin in children

儿童使用抗胸腺细胞球蛋白进行人类白细胞抗原7/8匹配的无关骨髓移植

• DOI: 10.1007/s12185-023-03571-5
• 发表时间: 2023
• 期刊: International Journal of Hematology
• 影响因子: 2.1
• 作者: Hamada Motoharu;Muramatsu Hideki;Torii Yuka;Suzuki Kyogo;Narita Atsushi;Yoshida Taro;Imaya Masayuki;Yamamori Ayako;Wakamatsu Manabu;Miwata Shunsuke;Narita Kotaro;Kataoka Shinsuke;Kawashima Nozomu;Taniguchi Rieko;Nishikawa Eri;Nishio Nobuhiro;Ito Yoshinori
• 通讯作者: Ito Yoshinori

A nationwide survey of late effects in survivors of juvenile myelomonocytic leukemia in Japan

日本幼年粒单核细胞白血病幸存者的晚期影响全国调查

• DOI: 10.1002/pbc.30126
• 发表时间: 2022
• 期刊: Pediatr Blood Cancer
• 影响因子: 3.2
• 作者: Ozono Shuichi;Sakashita Kazuo;Yoshida Nao;Kakuda Harumi;Watanabe Kenichiro;Maeda Miho;Ishida Yasushi;Manabe Atsushi;Taga Takashi;Muramatsu Hideki
• 通讯作者: Muramatsu Hideki