Development of detection method for multiple disease-causative proteins using dried blood spots

开发利用干血斑检测多种致病蛋白的方法

• 批准号: 21K07877
• 负责人: 中島 大輔
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kazusa DNA Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07877/
• 关键词: 乾燥ろ紙血; 新生児スクリーニング; プロテオーム解析; LC-MS; 炭酸ナトリウム沈殿

乾燥ろ紙血から抽出した蛋白質に特化した高深度プロテオーム解析法の開発を行った。血液蛋白質はこれまで解析してきた培養細胞や生体組織と蛋白質の種類や濃度のダイナミックレンジが大きく異なるためシステムを再構築する必要がある。LC-MSのLCシステムについては、カラム充填剤の種類、カラム長、流速などを最適化した。MS部分についてはより多くの乾燥ろ紙血蛋白質を観測する為のイオン化法の改良、DIA法のMSレンジ、Isolation window幅、フラグメントイオンの蓄積時間などのパラメーターやノイズ除去の為のイオンモビリティーの電圧条件を最適化した。またin silico蛋白質同定用データベースを構築することにより、最終的に1検体1測定により乾燥ろ紙血から500以上の疾患原因蛋白質を含む3,000以上の蛋白質の同定・定量することができた。

Dry paper blood is extracted and the protein is specialized and the high-depth analysis method is opened and the line is opened. Blood protein analysis, cultured cells, biological tissue, protein types and concentrationのダイナミックレンジが大きくdifferent なるためシステムを Rebuild するNecessary がある. LC-MS's LC type, LC filling type, LC length, and flow rate optimization are all available. MS part of the paper blood protein measurement method is improved, the DIA method is MS method, Isolation Window width, フラグメントイオンの accumulate time などのパラメーターやノイズRemoval is the optimization of the のイオンモビリティーのelectrical pressure condition.またin The silico protein is determined using the silico protein structure and the final body 1 is measured and dried. The protein content of the cause of the disease is more than 500, and the protein content is more than 3,000.

项目成果

乾燥ろ紙血を対象とした高深度プロテオーム解析

干燥滤纸血液的深度蛋白质组分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 中島 大輔;小原 收;川島 祐介
• 通讯作者: 川島 祐介

Development of a Simple and Stable NanoESI Spray System Using Suction Wind from the MS Inlet

• DOI: 10.1021/acs.jproteome.3c00146
• 发表时间: 2023-04-10
• 期刊: JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
• 影响因子: 4.4
• 作者: Kawashima, Yusuke;Ishikawa, Masaki;Ohara, Osamu
• 通讯作者: Ohara, Osamu

臨床プロテオミクスを目指した炭酸ナトリウム沈殿法を用いて調製した乾燥ろ紙血由来のタンパク質の簡便かつ高感度な解析法の開発

开发一种简单且高灵敏度的分析方法，用于临床蛋白质组学中使用碳酸钠沉淀法制备的干燥滤纸血液中的蛋白质

• 发表时间: 2022
• 作者: 中島大輔;小原收;川島祐介
• 通讯作者: 川島祐介