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Integration of viral genome in nails.

病毒基因组在指甲中的整合。

基本信息

批准号：
21K08517
负责人：
小松陽樹
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Toho University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、爪と血液細胞においてB型肝炎ウイルス（HBV）及びヒトヘルペスウイルス科ウイルスのヒトゲノムへのintegrationの有無を明らかにすることである。HBVキャリアを対象として、rea-time PCR, target-capture次世代シークエンス、サンガーシークエンスを実施し、爪と血液細胞におけるウイルスのintegration siteの同定を試みた。HBVキャリア60人（年齢:：median 15歳、HBeAg陽性：47人）から爪を採取した。爪細胞においてPCR法にてHBV DNAは37人（61.7％）から検出された（Nail HBV DNA levels: median 4.3 Log copies/mL)。さらに、ヘルペス科ウイルスに属する①HSV-1,②HSV-2,③VZV, ④EBV,⑤CMV,⑥HHV-6,⑦HHV-7の7種類のウイルスDNAをPCR法にて測定し、HHV-7 DNAのみが3人（5.0％）から検出された（HHV-7 DNA level: median 2.8 Log copies/mL）。次に、ウイルスゲノムのintegrationの有無を調べるためHBV DNA陽性かつHHV-７DNA陽性の血液細胞と爪細胞を用いて、target-capture 次世代シークエンシングを行った。次世代シークエンシングでは血液及び爪において、HBVとHHV-7のintegration siteを検出することができた。しかし、サンガーシークエンスでintegration siteを再確認できたのは、血液細胞におけるHBVのintegration siteのみであった。【結論】血液細胞へのHBVのintegrationは確認できたが、血液細胞へのHHV-7と爪細胞へのウイルスゲノムのintegrationは確認することができなかった。

The aim of this study was to clarify the existence and non-existence of hepatitis B virus (HBV) and hepatitis B virus (HBV) in blood cells. HBV detection, target-capture, re-time PCR, target-capture, and integration site identification of the next generation 60 HBV carriers (age: median 15 years, HBeAg positive: 47) were identified. HBV DNA was detected in 37 patients (61.7%) by PCR (Nail HBV DNA levels: median 4.3 Log copies/mL). The DNA of HSV-1, HSV-2, VZV, EBV, CMV, HHV-6 and HHV-7 was detected by PCR in 3 persons (5.0%) and detected in 3 persons (HHV-7 DNA level: median 2.8 Log copies/mL). HBV DNA positive, HHV-7DNA positive, blood cells and claw cells are used, target-capture, next-generation, and next-generation. The next generation of HBV and HHV-7 integration sites The integration site of HBV was reconfirmed. [Conclusion] The integration of HBV in blood cells and HHV-7 in blood cells is confirmed.