EBV関連胃癌におけるエピゲノム異常によるARID1A遺伝子の発現制御機序の解明

阐明EBV相关胃癌表观基因组异常对ARID1A基因表达的调控机制

• 批准号: 21K08675
• 负责人: 齋藤 元伸
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Fukushima Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08675/
• 关键词: EBV関連胃癌; エピゲノム異常; ARID1A遺伝子変異; ARID1A遺伝子

EBV関連胃癌におけるDNAプロモーターメチル化の状態をパブリックデータベースであるGEO（Gene Expression Omnibus）に登録されたメチレーションアレイデータを用いて解析をいおこなった。アレイデータと同じくダウンロードした臨床病理学的因子を合わせて解析をおこなった結果、EBV関連胃癌はEBV陰性胃癌と比べて非常に多くの遺伝子のプロモーターが高メチル化状態、つまり、遺伝子発現がなされていない状態であることがわかった。実際に細胞実験で検討したところ、EBV感染陽性MKN7胃癌細胞は非感染コントロール細胞と比べて、高メチル化状態であることが確認された。これらの結果から、EBV感染自体が細胞内の数多くの遺伝子のプロモーター高メチル化を促すことが確認され、EBV関連胃癌のエピゲノム異常の特徴を捉えることができた。次に、これらの解析データからARID1A遺伝子に着目したところ、EBV関連胃癌とEBV感染陽性胃癌細胞株においてARID1Aプロモーターは高メチル化されてないことがわかった。同じサンプルにおける、ARID1A　mRNAの発現解析をマイクロアレイ（GSE31787）でおこなうと、EBV感染に伴うARID1A　mRNA発現の影響は認められなかった。つまり、EBV関連胃癌におけるARID1Aタンパクの発現低下は、ARID1A遺伝子の転写の段階ではなく、翻訳後の段階でおこることがわかった。

EBV is associated with gastric cancer, and the DNA profile is analyzed in the Gene Expression Omnibus (GEO) registry. The analysis of factors in clinical pathology shows that EBV-associated gastric cancer EBV-negative gastric cancer is more common than EBV-negative gastric cancer. In the meantime, the cells were infected with EBV and MKN7 gastric cancer cells were not infected with EBV. These results suggest that EBV infection is associated with increased intracellular levels of DNA and increased cellular differentiation. EBV-associated gastric cancer is characterized by abnormal DNA. ARID1A gene expression was detected in EBV-associated gastric cancer and EBV-positive gastric cancer cell lines. ARID1A mRNA Expression Analysis (GSE31787), EBV Infection Associated with ARID1A mRNA Expression ARID1A gene expression is lower in EBV-related gastric cancer, ARID1A gene expression is lower in EB

项目成果

胃癌におけるARID1A発現とその下流のANXA遺伝子群発現の相互関連

胃癌中ARID1A表达与其下游ANXA基因组表达的相互关系

• 发表时间: 2022
• 作者: 齋藤元伸;片方雅紀;小野澤寿志;岡山洋和;藤田正太郎;坂本渉;佐瀬善一郎;門馬智之;河野浩二
• 通讯作者: 河野浩二

消化器癌におけるARID1A発現とその下流のANXA遺伝子群発現の相互関連

胃肠道肿瘤中ARID1A表达及其下游ANXA基因表达的相互关系

• 发表时间: 2021
• 作者: 齋藤元伸;山田玲央;菅家康之;小野澤寿志;岡山洋和;藤田正太郎;坂本渉;佐瀬善一郎;門馬智之;河野浩二
• 通讯作者: 河野浩二

SH2D4A downregulation due to loss of chromosome 8p is associated with poor prognosis and low T cell infiltration in colorectal cancer

由于 8p 染色体缺失导致的 SH2D4A 下调与结直肠癌预后不良和 T 细胞浸润低相关

• DOI: 10.1038/s41416-021-01660-y
• 发表时间: 2021
• 期刊: British Journal of Cancer
• 影响因子: 8.8
• 作者: Matsumoto Takuro;Okayama Hirokazu;Nakajima Shotaro;Saito Katsuharu;Ito Misato;Kaneta Akinao;Kanke Yasuyuki;Onozawa Hisashi;Hayase Suguru;Fujita Shotaro;Sakamoto Wataru;Saito Motonobu;Seze Zenichiro;Momma Tomoyuki;Mimura Kosaku;Kono Koji
• 通讯作者: Kono Koji

The Expression of Immune Checkpoint Receptors and Ligands in the Colorectal Cancer Tumor Microenvironment

• DOI: 10.21873/anticanres.15303
• 发表时间: 2021-10-01
• 期刊: ANTICANCER RESEARCH
• 影响因子: 2
• 作者: Neupane, Prajwal;Mimura, Kosaku;Kono, Koji
• 通讯作者: Kono, Koji

Immune escape mechanism behind resistance to anti-PD-1 therapy in gastrointestinal tract metastasis in malignant melanoma patients with multiple metastases

• DOI: 10.1007/s00262-022-03154-z
• 发表时间: 2022-01-30
• 期刊: CANCER IMMUNOLOGY IMMUNOTHERAPY
• 影响因子: 5.8
• 作者: Ito, Misato;Mimura, Kosaku;Kono, Koji
• 通讯作者: Kono, Koji