ワンヘルスに基づいた生活環境由来細菌の疫学解析と全ゲノム解析

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薬剤耐性対策には医療のみならず，動物，食品，環境等を含めた分野横断的に取組むこと，すなわちワンヘルスアプローチが重要である。ブドウ球菌属細菌は現在49種類が知られており，中でも黄色ブドウ球菌（S. aureus）は病原性が高く，院内感染，及び食中毒の原因菌として注視されている。血液凝集素コアグラーゼを分泌するか否かにより二分され，黄色ブドウ球菌はコアグラーゼ産生し，コアグラーゼ遺伝子を持たない種はコアグラーゼ陰性ブドウ球菌（CoNS）と総称される。ブドウ球菌属細菌は種，または同じ種内でも遺伝子型（sequence type: ST）により一定の宿主特異性があり，主にヒトから分離される CoNS としてS. epidermidis, S. lugdunensis, S. haemolyticus, S. saprophyticus, S. warneri が挙げられ，家畜から分離される CoNSは S. xylosus, S. chromogenes, S. equorum, S. similans が多い。S. aureus は比較的広い動物種から検出されるが，動物ごとに分離率の高い遺伝子型がみられ，それらの適応性獲得に寄与する遺伝子変異が推定されているものもある。本研究は，その特徴に着目し，生活環境におけるブドウ球菌属細菌の分布と薬剤耐性を調査し，ゲノム配列に基づいた比較解析・系統解析を通して耐性遺伝子の進化，及び伝播の様態を明らかにすることを目的とする。現在まで食肉から分離される菌体解析を中心に行っている。同定された菌種から家畜由来の菌体と，サプライチェーン等から混入する菌体が混在していると考えられ，薬剤感受性のパターンから食肉中の菌体とヒト感染起因菌との直接的な関連を示唆するものではないと推察した。