Association analysis of the SNPs of ER and lung adenocarcinoma risk in Japanese non-smokers.

日本非吸烟者 ER 的 SNP 与肺腺癌风险的关联分析。

• 批准号: 20K07655
• 负责人: 陶 弘
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Hamamatsu University School of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K07655/
• 关键词: lung adenocarcinoma; estrogen recepter; SNP; 肺腺癌; エストロゲン受容体; 一塩基多型（SNP)

日本を含むアジア各国では、非喫煙者肺腺癌の割合が増加傾向にあり、特に女性の発症が多いことから、女性ホルモン関連遺伝子との関係を明らかにするために、本研究はエストロゲン受容体（ER)遺伝子における一塩基多型（SNP)について調べた。今年度はまずエストロゲン受容体の二つ亜型（αとβ）のSNPをデータベースから検索し、肺腺癌発症リスクとの関連を報告した論文からターゲットSNPを絞る。ERαは肺腺癌組織での発現は少ないとされてきている中、複数のSNPが肺腺癌との関連を中国大陸と台湾のグループで報告されている。この中4つのSNPsに絞って、データベース上でそれぞれ連鎖不平衡による影響の有無を確認したうえ、解析のターゲットとして決めた。同じ東アジア国の日本の非喫煙者肺腺癌症例におけるこれらのターゲットSNPsの頻度を調べるために、まず日本人非喫煙者肺腺癌270症例と癌なしの健常人コントロールサンプル330例を選出し、凍結手術検体と血液検体からゲノムDNAを抽出した。その一部のDNAサンプルを使って、PCR-sequencing法により、4つのターゲットSNPsのスクリーニングを行い、それぞれの野生型、変異型とヘテロ接合型の検体を確認し、ポジティブコントロールとして使った。残りの症例と対照サンプルをTaqMan SNP Genotyping Assayを用いて遺伝子型を同定し、そのデータを統計解析により、肺腺癌リスクとの関連を調べた。とりあえず1つのSNPに関して、野生型に比べて、ヘテロ接合型と変異型ともに有意差が認められなかった。さらに優性モデルと劣性モデルでの解析でも有意差が認められなかった。

Japan を containing む ア ジ ア countries で は, not eat smoke lung adenocarcinoma の cut close が rights and tendency に あ り, に women の 発 disease more than が い こ と か ら, female ホ ル モ ン masato even heritage 伝 son と の masato を and Ming ら か に す る た め に, this study は エ ス ト ロ ゲ ン by let body (ER) heritage 伝 son に お け る type a salt Quito (SNP) に つ い て adjustable べ た. Our は ま ず エ ス ト ロ ゲ ン by let body の two つ 亜 type (alpha と beta) の SNP を デ ー タ ベ ー ス か ら 検 cable し, lung adenocarcinoma 発 リ ス ク と の masato even を report し た paper か ら タ ー ゲ ッ ト SNP を ground る. ER alpha は lung adenocarcinoma tissue で の 発 は now less な い と さ れ て き て い る, plural の SNP が lung adenocarcinoma と の masato even を China と Taiwan の グ ル ー プ で report さ れ て い る. こ の in 4 つ の SNPs に ground っ て, デ ー タ ベ ー ス on で そ れ ぞ れ linkage disequilibrium に よ る influence の presence of を confirm し た う え, parse の タ ー ゲ ッ ト と し て definitely め た. With じ east ア ジ の の ア countries Japan eat smoke in lung adenocarcinoma cancer に お け る こ れ ら の タ ー ゲ ッ ト SNPs の frequency を adjustable べ る た め に, ま ず Japanese people eat not to smoke, 270 patients with lung adenocarcinoma cases と carcinoma な し の healthy normal コ ン ト ロ ー ル サ ン プ ル 330 cases を elected し, freezing operation 検 と blood 検 か ら ゲ ノ ム を DNA extraction し た. そ の a の DNA サ ン プ ル を make っ て, PCR - sequencing method に よ り, 4 つ の タ ー ゲ ッ ト SNPs の ス ク リ ー ニ ン グ を い, そ れ ぞ れ の wild-type, - alien と ヘ テ ロ mating type の 検 を confirm し, ポ ジ テ ィ ブ コ ン ト ロ ー ル と し て make っ た. Residual り の cases と polices according to サ ン プ ル を TaqMan SNP Genotyping Assay を with い て heritage 伝 sub-type を with し, そ の デ ー タ を statistical parsing に よ り, lung adenocarcinoma リ ス ク と の masato even を adjustable べ た. と り あ え ず 1 つ の SNP に masato し て, wild type に than べ て, ヘ テ ロ mating type と - alien と も に deliberately bad が recognize め ら れ な か っ た. さ ら に prepotency モ デ ル と recessive モ デ ル で の parsing で も deliberately bad が recognize め ら れ な か っ た.