皮膚微小環境において極小マイクロバイオームが果たす役割の解明

阐明微小微生物组在皮肤微环境中所起的作用

• 批准号: 20K08669
• 负责人: 中島 沙恵子
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08669/
• 关键词: 皮膚マイクロバイオーム; 極小マイクロバイオーム; レーザーキャプチャーマイクロダイセクション

本研究の目標は、これまで皮膚という臓器全体として解析されてきた皮膚マイクロバイオームを皮膚の微小構造物ごとに細分化し理解することである。すなわ ち、汗腺や脂腺、毛包といった皮膚付属器周辺の極小皮膚マイクロバイオームの詳細を明らかにし、さらにこの極小皮膚マイクロバイオームの炎症性皮膚疾患の 病態への関与について明らかにすることを目標としている。昨年に引き続き、皮膚極小マイクロバイオーム解析を行うために、Laser capture microdissection (LCM)法を用い、ヒト皮膚サンプルより微小環境ごとの微生物DNA抽出を行なった。 具体的には、LCM法により手術余剰皮膚より作成した皮膚切片から表皮・真皮・毛包・汗腺・皮下組織などの微小組織の切り出しを行い、バクテリアDNA抽出を行なった。 １切片あたり抽出可能なバクテリアDNA量を算出した。抽出したバクテリアDNAを用いて、分担研究者研究室にてDNA増幅の検討を行い、さらにライブラリ調整、16s rRNAシーケンスを行い、微生物叢解析を行なったところ、それぞれの微小構造に特徴的な細菌叢のデータを得ることに成功した。これまでの報告にあるように、真皮・皮下組織でも細菌DNAは検出された。また、毛包や脂腺・汗腺のデータも問題なく取得できた。全体を通じて細菌叢の多くを占めた菌種はCutibacterium属であり、こちらはこれまでの皮膚常在微生物叢解析で明らかにされている皮膚常在細菌叢に特徴的な菌種であることから、獲得したデータに大きな問題はないと考えている。現在、linear discriminant analysisを行い、それぞれの微小環境を特徴づけている細菌種の同定を試みている。

The purpose of this study is to analyze the whole structure of skin and to understand the micro-structure of skin The pathological relationship between inflammatory skin diseases and the purpose of skin accessories with very small skin around the skin accessories In the past year, the application of Laser capture microdissection (LCM) method in skin microdissection and microbial DNA extraction in microenvironment was studied. The specific LCM method is used to prepare skin slices from the surgical surplus, epidermis, hair follicle, sweat gland, subcutaneous tissue, and extract DNA. 1. Calculate the amount of DNA extracted. DNA amplification was successfully investigated in the laboratory of the researchers who extracted DNA from the samples, adjusted the DNA amplification, analyzed the microflora, and characterized the microflora. This report contains bacterial DNA from dermis and subcutaneous tissue. The hair gland, sweat gland, and other problems are not easy to obtain. All the bacteria in the flora belong to the genus Cutibacterium, and the skin often exists in the flora. The bacteria in the flora are characterized by the flora. Now, linear discriminant analysis is performed, and the microenvironment characteristics of the bacteria species are analyzed.