歯周病原因菌の病原性因子及び挿入配列を制御するsmall RNAの解析
歯周病原因菌の病原性因子及び挿入配列を制御するsmall RNAの解析
批准号:
20K09922
负责人:
大貝 悠一
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
Aggregatibacter actinomycetemcomitansのsmall RNA発現性の解析を目的とし、RNAシャペロンのひとつでありsRNAを介した発現制御に関与するhfqの欠損株、外環境の刺激に応答し各種遺伝子やsRNAの制御を担う2成分制御系の欠損株の解析を行った。一部の2成分制御系因子の欠損株においてはヒト培養細胞への付着性、酸化ストレスに対する抵抗性に変化が認められたため、現在詳細なメカニズムの検討中である。下流遺伝子の解析においては二次元電気泳動法により酸化ストレスに変動を示す2成分制御系欠損株1株においてTCA回路で働く因子のタンパク発現量の増加を認めた。同欠損株を用いたRNAseq解析においては嫌気呼吸関連因子や酸化ストレス関連因子の発現変動を複数認めた。これら個別の因子とTCSの関連を現在検討中である。hfq欠損株は二次元電気泳動で複数の著明な発現変動を示すタンパクが見られる。RNAseq解析においては外膜タンパクの一種であるオートトランスポーターなど病原性との関連が示唆されている因子の発現変動を確認した。これらの発現制御に関与するsRNAの探索を今後行う予定である。Fusobacteirum nucleatumは歯周病原因菌の一つである。本菌は他細菌と結合する(共凝集)ことにより、口腔内のプラーク成熟に重要な役割を持つと考えられている。当研究では本菌にも着目し、Hfqタンパクやその他2成分制御系などのレギュレーターの遺伝子欠損株の解析から既報のF. nucleatum sRNAの発現性などを解析する予定である。
英文摘要
Aggregatibacter actinomycetemcomitansのsmall RNA発現性の解析を目的とし、RNAシャペロンのひとつでありsRNAを介した発現制御に関与するhfqの欠損株、外環境の刺激に応答し各種遺伝子やsRNAの制御を担う2成分制御系の欠損株の解析を行った。一部の2成分制御系因子の欠損株においてはヒト培養細胞への付着性、酸化ストレスに対する抵抗性に変化が認められたため、現在詳細なメカニズムの検討中である。下流遺伝子の解析においては二次元電気泳動法により酸化ストレスに変動を示す2成分制御系欠損株1株においてTCA回路で働く因子のタンパク発現量の増加を認めた。同欠損株を用いたRNAseq解析においては嫌気呼吸関連因子や酸化ストレス関連因子の発現変動を複数認めた。これら個別の因子とTCSの関連を現在検討中である。hfq欠損株は二次元電気泳動で複数の著明な発現変動を示すタンパクが見られる。RNAseq解析においては外膜タンパクの一種であるオートトランスポーターなど病原性との関連が示唆されている因子の発現変動を確認した。これらの発現制御に関与するsRNAの探索を今後行う予定である。Fusobacteirum nucleatumは歯周病原因菌の一つである。本菌は他細菌と結合する(共凝集)ことにより、口腔内のプラーク成熟に重要な役割を持つと考えられている。当研究では本菌にも着目し、Hfqタンパクやその他2成分制御系などのレギュレーターの遺伝子欠損株の解析から既報のF. nucleatum sRNAの発現性などを解析する予定である。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI:
10.1111/1348-0421.12864
发表时间:
2021-02-16
期刊:
MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY
影响因子:
2.6
作者:
[Fujita,Ayumi, Oogai,Yuichi, Komatsuzawa,Hitoshi]
通讯作者:
Komatsuzawa,Hitoshi
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