RNA-protein interactomics to read the yeast mRNP code
RNA-蛋白质相互作用组学读取酵母 mRNA 代码
基本信息
- 批准号:313087757
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Priority Programmes
- 财政年份:2016
- 资助国家:德国
- 起止时间:2015-12-31 至 2019-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
We here propose to use mass spectrometry to identify protein binding partners at the level of individual RNA folds and to define an RBP interactome network based on quantitative interactome data. We will use our streamlined RNA-protein interactomics approach to uncover RNA-binding proteins at phylogenetic supported mRNA folds and characterize RNA-dependent mRBP composition in S. cerevisiae. Besides uncovering systematically the functionality of these RNA readers in yeast for a systems perspective, our technique is scalable and widely applicable to any RNA structure and species. It thus can contribute to deciphering the mRNP code also in other model systems.
我们在此建议使用质谱法在单个 RNA 折叠水平上识别蛋白质结合伴侣,并根据定量相互作用组数据定义 RBP 相互作用组网络。我们将使用简化的 RNA-蛋白质相互作用组学方法来揭示系统发育支持的 mRNA 折叠中的 RNA 结合蛋白,并表征酿酒酵母中 RNA 依赖性 mRBP 组成。除了从系统角度系统地揭示酵母中这些 RNA 阅读器的功能之外,我们的技术还具有可扩展性并广泛适用于任何 RNA 结构和物种。因此,它也有助于破译其他模型系统中的 mRNP 代码。
项目成果
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