Elucidation of Clostridioides difficile transmission pattern based on One Health conception

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2023年3月31日までの時点で、383検体より111株を収集した。CACDI症例においては2施設11例より12株が収集された。伴侶動物由来検体は5施設より収集され、C. difficile検出率は猫7.1%（2/28検体、いずれもTOX-）、犬50%（15/30検体、TOX+4検体）と犬で多く分離された。家畜・家禽における検出率は、牛11％（15/135検体、TOX+9検体、17施設）で、家禽（56検体、8施設）、豚（40検体、4施設）からは検出されなかった。土壌からの検出率は、45.9%(17/37検体、TOX+12検体、公共の地域的に離れた８公園) で毒素産生株の検出率も高く、砂場や遊具下の土壌などから検出された。MLST解析ではST2の分離頻度が最も多く（tcdA+tcdB+cdtA-cdtB-, 10株）、ST42（tcdA+tcdB+cdtA-cdtB-, 9株）、ST15(non-toxigenic, 6株)が続き、分類不能を除く15種類のSTに分類された。ST2, ST42, ST15, ST100, ST203は複数の検体種類から分離されており、ST 42、ST100、ST203は犬、土壌、患者で共通して検出された。tcdA+tcdB+cdtA+cdtB+は1株のみCACDI患者より検出された（ST47）。複数の検体種類から分離されたSTについて、core-genome SNPs 解析を実施した。その結果、ST42において患者と患者生活環境の公園土壌由来株、犬と公園土壌由来株は近縁株と推定された（SNPs≦20）。ST２においては公園間で、ST100においては公園と犬において近縁株が検出された。ST1，ST203に関しては各々の菌株に関連性は認められなかった（SNPs≧30）。CACDI伝播様式として、特にST42において、ヒト、伴侶動物、土壌における関連性がある可能性が示唆された。