In-cell 19F-NMRを用いたヒト細胞における非標準DNA構造の探索
In-cell 19F-NMRを用いたヒト細胞における非標準DNA構造の探索
批准号:
20K15402
负责人:
鮑 宏亮
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2022-03-31
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英文摘要
生細胞内での非標準構造DNAの構造、特性などを調べることは、それらの生物学的機能と疾患治療薬の開発を理解するのに役立つ。しかしながら、細胞内生物物理学的および生化学的方法の欠如は、生細胞内の生体分子の構造探索を制限している。このような現状を踏まえ、以前の研究に基づいて“フッ素科学”を応用することで、19F-NMRにより上述の問題点を一挙に解決し、非標準構造DNAの細胞内における可視化を実現出来るのではないかと考えた。19F-NMR分光法を用いて、生細胞内環境下での非標準構造DNA構造の解析をおこなった。具体的には、まず19F-NMRセンサーとしてフッ素化2'-デオキシ-グアノシン(CF3-dG)および2'-グアノシン(CF3-rG)誘導体を新規に合成した。次に、細胞表面に細孔を形成する毒素タンパク質ストレプトリジンO(SLO)を用いて生細胞(Hela細胞)内に19Fで標的したDNA核酸配列を導入した。SLOは原形質膜のコレステロールと結合することができ、SLOオリゴマー化は直径30nmの原形質膜に細孔を形成し、生体分子の細胞への透過化を可能にする。この細孔は、カルシウムイオンを添加することで閉じることが可能である。19F-NMR分光法を用いてin vitro試験管内および生細胞(Hela細胞)内の19F-NMRスペクトルを比較し、核酸-タンパク質および核酸-小分子の相互作用の解析をおこなった。細胞内の非標準的なDNA立体構造の可視化を実現した。
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Systematic Approach to DNA Aptamer Design Using Amino Acid?Nucleic Acid Hybrids (ANHs) Targeting Thrombin
使用靶向凝血酶的氨基酸核酸杂交体 (ANH) 设计 DNA 适体的系统方法
DOI:
10.1021/acsbiomaterials.1c00060
发表时间:
2021
期刊:
ACS Biomaterials Science & Engineering
影响因子:
5.8
作者:
[Yum Ji Hye, Ishizuka Takumi, Fukumoto Koyuki, Hori Daisuke, Bao Hong-Liang, Xu Yan, Sugiyama Hiroshi, Park Soyoung]
通讯作者:
Park Soyoung
Improved thrombin binding aptamer by incorporation of 8-trifluoromethyl-2'deoxyguanosine
通过掺入 8-三氟甲基-2脱氧鸟苷改进凝血酶结合适体
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[鮑宏亮, 徐岩]
通讯作者:
徐岩
DOI:
10.1021/acs.jmedchem.0c01711
发表时间:
2021-01-14
期刊:
JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY
影响因子:
7.3
作者:
[Bao, Hong-Liang, Ishizuka, Takumi, Xu, Yan]
通讯作者:
Xu, Yan
宮崎大学医学部機能制御学講座生命分子科学分野研究室ホームページ
宫崎大学医学院功能控制系生物分子科学实验室主页
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
国内基金
海外基金
19F-NMR用于小分子靶向核酸G-四链体的活细胞探测
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:刘文婷
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依托单位:
19F标记非天然氨基酸的合成及结合19F-NMR探索蛋白质泛素化动态调控机制研究
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批准号:21977089
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项目类别:面上项目
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资助金额:66.0万元
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批准年份:2019
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负责人:石景
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依托单位: