19F NMR分子技術の開発によるヒト細胞内DNA及びRNA高次構造の解明
19F NMR分子技術の開発によるヒト細胞内DNA及びRNA高次構造の解明
批准号:
21H02081
负责人:
徐 岩
金额:
$11.23万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
ヒト細胞内のDNA及びRNA高次構造は重要な生物学的役割を果たし、いくつかの疾患と重要な関係があることが報告されている。ヒト細胞内のDNA及びRNA高次構造を調べることは、それら高次構造の生物学的機能の理解と疾患治療薬の開発に役立つ。しかし、現在、最も有力な構造生物学的手法(X線結晶構造解析法など)は、生きた細胞に適用できないために、現状では、細胞内での高次構造を直接解析する有効な手段は少ない。このような背景を踏まえて、我々は“フッ素科学”を応用することで、In-Cell 19F-NMRにより上述の問題点を一挙に解決する。申請研究計画では、フッ素を含む19F-NMRセンサーを創製し、DNA及びRNA配列に導入して、In-Cell 19F-NMRによりヒト細胞中におけるDNA及びRNA高次構造を解析する。またこれらの高次構造とタンパク質の相互作用を解明する。この方法により、細胞内のDNA及びRNA高次構造の重要な生物学的役割をIn Cellで解明するための研究基盤を構築する。2022年度はIn-Cell 19F-NMRを駆使して、細胞内テロメア四重鎖DNA及びRNA構造を解析し、Z型DNA及びRNAの検出を行なった。細胞内の四重鎖構造について、研究成果を3篇の論文および2編の図書として発表し、また国際学会で3件の発表を行なった。
英文摘要
ヒト細胞内のDNA及びRNA高次構造は重要な生物学的役割を果たし、いくつかの疾患と重要な関係があることが報告されている。ヒト細胞内のDNA及びRNA高次構造を調べることは、それら高次構造の生物学的機能の理解と疾患治療薬の開発に役立つ。しかし、現在、最も有力な構造生物学的手法(X線結晶構造解析法など)は、生きた細胞に適用できないために、現状では、細胞内での高次構造を直接解析する有効な手段は少ない。このような背景を踏まえて、我々は“フッ素科学”を応用することで、In-Cell 19F-NMRにより上述の問題点を一挙に解決する。申請研究計画では、フッ素を含む19F-NMRセンサーを創製し、DNA及びRNA配列に導入して、In-Cell 19F-NMRによりヒト細胞中におけるDNA及びRNA高次構造を解析する。またこれらの高次構造とタンパク質の相互作用を解明する。この方法により、細胞内のDNA及びRNA高次構造の重要な生物学的役割をIn Cellで解明するための研究基盤を構築する。2022年度はIn-Cell 19F-NMRを駆使して、細胞内テロメア四重鎖DNA及びRNA構造を解析し、Z型DNA及びRNAの検出を行なった。細胞内の四重鎖構造について、研究成果を3篇の論文および2編の図書として発表し、また国際学会で3件の発表を行なった。
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In Cell 19F NMR for G-quadruplex. In: Sugimoto, N. (eds) Handbook of Chemical Biology of Nucleic Acids.
在 Cell 19F NMR 中检测 G-四链体。
DOI:
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发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[篠崎一世, 藤本健造, Yan Xu]
通讯作者:
Yan Xu
RNA二重鎖から形成される新規RNA G-quadruplex:COVID-19 mRNAの二量体化への影響
由 RNA 双链体形成的新型 RNA G-四链体:对 COVID-19 mRNA 二聚化的影响
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[徐岩, 宋藝, 王詩宇]
通讯作者:
王詩宇
Oligonucleotide Containing 8-Trifluoromethyl-2′-Deoxyguanosine as a Z-DNA Probe. In: Kim, K.K., Subramani, V.K. (eds) Z-DNA.
含有 8-三氟甲基-2-脱氧鸟苷的寡核苷酸作为 Z-DNA 探针:Kim, K.K., Subramani, V.K.(编辑)Z-DNA。
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Takuma Owaki , Shingo Kasamatsu , Hideshi Ihara, Hong-Liang Bao and Yan Xu]
通讯作者:
Hong-Liang Bao and Yan Xu
Dimerization of COVID-19 mRNA formed by an unusual topological RNA G-quadruplex
由不寻常的拓扑 RNA G 四链体形成的 COVID-19 mRNA 二聚化
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yi Song, Shiyu Wang, Yan Xu]
通讯作者:
Yan Xu
ADAR1 masks the cancer immunotherapeutic potential of ZBP1-driven necroptosis
ADAR1 掩盖了 ZBP1 驱动的坏死性凋亡的癌症免疫治疗潜力
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
Nature
影响因子:
64.8
作者:
[Ting Zhang, Chaoran Yin, Aleksandr Fedorov, Liangjun Qiao, Hongliang Bao, Nazar Beknazarov, Shiyu Wang, Avishekh Gautam, Suraj Peri, Vasily Studitsky, Carl Walkley, Yan Xu, Maria Poptsova, Alan Herbert, Riley Williams, Jeremy Crawford, Amer Beg, Paul Thom]
通讯作者:
Paul Thom
共 17 条
非標準型核酸の構造・機能及び蛋白質との相互作用の解明を目指したケミカルバイオロジー
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批准号:24K01648
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.9万
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财政年份:2024
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负责人:徐 岩
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依托单位:
国内基金
海外基金
19F-NMR用于小分子靶向核酸G-四链体的活细胞探测
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批准号:--
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项目类别:面上项目
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资助金额:54万元
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批准年份:2022
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负责人:刘文婷
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依托单位:
19F标记非天然氨基酸的合成及结合19F-NMR探索蛋白质泛素化动态调控机制研究
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批准号:21977089
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项目类别:面上项目
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资助金额:66.0万元
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批准年份:2019
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负责人:石景
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依托单位: